Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUS6

Mid2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid2Q9QUS6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mid2Q9QUS6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mid2Q9QUS6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Mid2Q9QUS6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mid2Q9QUS6 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mid2Q9QUS6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mid2Q9QUS6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Mid2Q9QUS6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mid2Q9QUS6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mid2Q9QUS6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mid2Q9QUS6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mid2Q9QUS6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mid2Q9QUS6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mid2Q9QUS6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mid2Q9QUS6 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mid2Q9QUS6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mid2Q9QUS6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Mid2Q9QUS6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mid2Q9QUS6 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mid2Q9QUS6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mid2Q9QUS6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mid2Q9QUS6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mid2Q9QUS6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mid2Q9QUS6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mid2Q9QUS6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mid2Q9QUS6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mid2Q9QUS6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mid2Q9QUS6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mid2Q9QUS6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mid2Q9QUS6 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mid2Q9QUS6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mid2Q9QUS6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Mid2Q9QUS6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mid2Q9QUS6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mid2Q9QUS6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mid2Q9QUS6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mid2Q9QUS6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mid2Q9QUS6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mid2Q9QUS6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mid2Q9QUS6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mid2Q9QUS6 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mid2Q9QUS6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mid2Q9QUS6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mid2Q9QUS6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mid2Q9QUS6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mid2Q9QUS6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mid2Q9QUS6 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mid2Q9QUS6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mid2Q9QUS6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mid2Q9QUS6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mid2Q9QUS6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mid2Q9QUS6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mid2Q9QUS6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mid2Q9QUS6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mid2Q9QUS6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mid2Q9QUS6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mid2Q9QUS6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mid2Q9QUS6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mid2Q9QUS6 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mid2Q9QUS6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mid2Q9QUS6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mid2Q9QUS6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mid2Q9QUS6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mid2Q9QUS6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mid2Q9QUS6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mid2Q9QUS6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Mid2Q9QUS6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mid2Q9QUS6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mid2Q9QUS6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mid2Q9QUS6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mid2Q9QUS6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mid2Q9QUS6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mid2Q9QUS6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mid2Q9QUS6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mid2Q9QUS6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mid2Q9QUS6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mid2Q9QUS6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mid2Q9QUS6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mid2Q9QUS6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mid2Q9QUS6 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mid2Q9QUS6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mid2Q9QUS6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mid2Q9QUS6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mid2Q9QUS6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mid2Q9QUS6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mid2Q9QUS6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mid2Q9QUS6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mid2Q9QUS6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mid2Q9QUS6 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mid2Q9QUS6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mid2Q9QUS6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mid2Q9QUS6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mid2Q9QUS6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mid2Q9QUS6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mid2Q9QUS6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Mid2Q9QUS6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mid2Q9QUS6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mid2Q9QUS6 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mid2Q9QUS6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Mid2Q9QUS6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms