Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM83

Calm4, Calmodulin-4, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calm4Q9JM83 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Calm4Q9JM83 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Calm4Q9JM83 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Calm4Q9JM83 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Calm4Q9JM83 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Calm4Q9JM83 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Calm4Q9JM83 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Calm4Q9JM83 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Calm4Q9JM83 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Calm4Q9JM83 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Calm4Q9JM83 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Calm4Q9JM83 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Calm4Q9JM83 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Calm4Q9JM83 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Calm4Q9JM83 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Calm4Q9JM83 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Calm4Q9JM83 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Calm4Q9JM83 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Calm4Q9JM83 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Calm4Q9JM83 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Calm4Q9JM83 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Calm4Q9JM83 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Calm4Q9JM83 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Calm4Q9JM83 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Calm4Q9JM83 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Calm4Q9JM83 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Calm4Q9JM83 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Calm4Q9JM83 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Calm4Q9JM83 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Calm4Q9JM83 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Calm4Q9JM83 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Calm4Q9JM83 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Calm4Q9JM83 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Calm4Q9JM83 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Calm4Q9JM83 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Calm4Q9JM83 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Calm4Q9JM83 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Calm4Q9JM83 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Calm4Q9JM83 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Calm4Q9JM83 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Calm4Q9JM83 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Calm4Q9JM83 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Calm4Q9JM83 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Calm4Q9JM83 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Calm4Q9JM83 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Calm4Q9JM83 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Calm4Q9JM83 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Calm4Q9JM83 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Calm4Q9JM83 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Calm4Q9JM83 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Calm4Q9JM83 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Calm4Q9JM83 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Calm4Q9JM83 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Calm4Q9JM83 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Calm4Q9JM83 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Calm4Q9JM83 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Calm4Q9JM83 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Calm4Q9JM83 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Calm4Q9JM83 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Calm4Q9JM83 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Calm4Q9JM83 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Calm4Q9JM83 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Calm4Q9JM83 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Calm4Q9JM83 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Calm4Q9JM83 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Calm4Q9JM83 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Calm4Q9JM83 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Calm4Q9JM83 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Calm4Q9JM83 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Calm4Q9JM83 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Calm4Q9JM83 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Calm4Q9JM83 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Calm4Q9JM83 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Calm4Q9JM83 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Calm4Q9JM83 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Calm4Q9JM83 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Calm4Q9JM83 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Calm4Q9JM83 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Calm4Q9JM83 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Calm4Q9JM83 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Calm4Q9JM83 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Calm4Q9JM83 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Calm4Q9JM83 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Calm4Q9JM83 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Calm4Q9JM83 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Calm4Q9JM83 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Calm4Q9JM83 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Calm4Q9JM83 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Calm4Q9JM83 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Calm4Q9JM83 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Calm4Q9JM83 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Calm4Q9JM83 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Calm4Q9JM83 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Calm4Q9JM83 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Calm4Q9JM83 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Calm4Q9JM83 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Calm4Q9JM83 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Calm4Q9JM83 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Calm4Q9JM83 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Calm4Q9JM83 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms