Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV5

Cul3, Cullin-3, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul3Q9JLV5 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cul3Q9JLV5 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cul3Q9JLV5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cul3Q9JLV5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cul3Q9JLV5 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cul3Q9JLV5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cul3Q9JLV5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cul3Q9JLV5 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cul3Q9JLV5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cul3Q9JLV5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cul3Q9JLV5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cul3Q9JLV5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cul3Q9JLV5 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cul3Q9JLV5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cul3Q9JLV5 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cul3Q9JLV5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cul3Q9JLV5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cul3Q9JLV5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cul3Q9JLV5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cul3Q9JLV5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cul3Q9JLV5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cul3Q9JLV5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cul3Q9JLV5 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cul3Q9JLV5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cul3Q9JLV5 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cul3Q9JLV5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cul3Q9JLV5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cul3Q9JLV5 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cul3Q9JLV5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cul3Q9JLV5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cul3Q9JLV5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cul3Q9JLV5 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cul3Q9JLV5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cul3Q9JLV5 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cul3Q9JLV5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cul3Q9JLV5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cul3Q9JLV5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cul3Q9JLV5 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cul3Q9JLV5 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cul3Q9JLV5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cul3Q9JLV5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cul3Q9JLV5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Cul3Q9JLV5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cul3Q9JLV5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cul3Q9JLV5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cul3Q9JLV5 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cul3Q9JLV5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cul3Q9JLV5 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cul3Q9JLV5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cul3Q9JLV5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cul3Q9JLV5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cul3Q9JLV5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cul3Q9JLV5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Cul3Q9JLV5 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cul3Q9JLV5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cul3Q9JLV5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cul3Q9JLV5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cul3Q9JLV5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cul3Q9JLV5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cul3Q9JLV5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Cul3Q9JLV5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cul3Q9JLV5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cul3Q9JLV5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cul3Q9JLV5 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cul3Q9JLV5 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cul3Q9JLV5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cul3Q9JLV5 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cul3Q9JLV5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cul3Q9JLV5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cul3Q9JLV5 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cul3Q9JLV5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cul3Q9JLV5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cul3Q9JLV5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cul3Q9JLV5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cul3Q9JLV5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cul3Q9JLV5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cul3Q9JLV5 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cul3Q9JLV5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cul3Q9JLV5 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cul3Q9JLV5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Cul3Q9JLV5 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cul3Q9JLV5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cul3Q9JLV5 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cul3Q9JLV5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Cul3Q9JLV5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cul3Q9JLV5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cul3Q9JLV5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Cul3Q9JLV5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Cul3Q9JLV5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cul3Q9JLV5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cul3Q9JLV5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cul3Q9JLV5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cul3Q9JLV5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cul3Q9JLV5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cul3Q9JLV5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cul3Q9JLV5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Cul3Q9JLV5 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cul3Q9JLV5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Cul3Q9JLV5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cul3Q9JLV5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms