Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX4

Aatf, Protein AATF, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 526 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AatfQ9JKX4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AatfQ9JKX4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AatfQ9JKX4 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AatfQ9JKX4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AatfQ9JKX4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AatfQ9JKX4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AatfQ9JKX4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AatfQ9JKX4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AatfQ9JKX4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AatfQ9JKX4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AatfQ9JKX4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AatfQ9JKX4 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AatfQ9JKX4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AatfQ9JKX4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AatfQ9JKX4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AatfQ9JKX4 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AatfQ9JKX4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AatfQ9JKX4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AatfQ9JKX4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AatfQ9JKX4 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AatfQ9JKX4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AatfQ9JKX4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AatfQ9JKX4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AatfQ9JKX4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AatfQ9JKX4 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AatfQ9JKX4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AatfQ9JKX4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AatfQ9JKX4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AatfQ9JKX4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AatfQ9JKX4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AatfQ9JKX4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
AatfQ9JKX4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AatfQ9JKX4 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AatfQ9JKX4 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AatfQ9JKX4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AatfQ9JKX4 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AatfQ9JKX4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AatfQ9JKX4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AatfQ9JKX4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AatfQ9JKX4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
AatfQ9JKX4 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AatfQ9JKX4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AatfQ9JKX4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
AatfQ9JKX4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AatfQ9JKX4 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AatfQ9JKX4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AatfQ9JKX4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AatfQ9JKX4 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AatfQ9JKX4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AatfQ9JKX4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AatfQ9JKX4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AatfQ9JKX4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AatfQ9JKX4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AatfQ9JKX4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AatfQ9JKX4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AatfQ9JKX4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AatfQ9JKX4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AatfQ9JKX4 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AatfQ9JKX4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AatfQ9JKX4 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
AatfQ9JKX4 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
AatfQ9JKX4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AatfQ9JKX4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
AatfQ9JKX4 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AatfQ9JKX4 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AatfQ9JKX4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
AatfQ9JKX4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AatfQ9JKX4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AatfQ9JKX4 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AatfQ9JKX4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AatfQ9JKX4 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AatfQ9JKX4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AatfQ9JKX4 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AatfQ9JKX4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AatfQ9JKX4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AatfQ9JKX4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AatfQ9JKX4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AatfQ9JKX4 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AatfQ9JKX4 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AatfQ9JKX4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AatfQ9JKX4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AatfQ9JKX4 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AatfQ9JKX4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AatfQ9JKX4 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AatfQ9JKX4 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AatfQ9JKX4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AatfQ9JKX4 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AatfQ9JKX4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AatfQ9JKX4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AatfQ9JKX4 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AatfQ9JKX4 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AatfQ9JKX4 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AatfQ9JKX4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AatfQ9JKX4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AatfQ9JKX4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AatfQ9JKX4 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AatfQ9JKX4 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AatfQ9JKX4 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AatfQ9JKX4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AatfQ9JKX4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms