Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN4

Oxct2a, Succinyl-CoA:3-ketoacid coenzyme A transferase 2A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Oxct2aQ9JJN4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Oxct2aQ9JJN4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Oxct2aQ9JJN4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Oxct2aQ9JJN4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Oxct2aQ9JJN4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Oxct2aQ9JJN4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Oxct2aQ9JJN4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Oxct2aQ9JJN4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Oxct2aQ9JJN4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Oxct2aQ9JJN4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Oxct2aQ9JJN4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Oxct2aQ9JJN4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Oxct2aQ9JJN4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Oxct2aQ9JJN4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Oxct2aQ9JJN4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Oxct2aQ9JJN4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Oxct2aQ9JJN4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Oxct2aQ9JJN4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Oxct2aQ9JJN4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Oxct2aQ9JJN4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Oxct2aQ9JJN4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Oxct2aQ9JJN4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Oxct2aQ9JJN4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Oxct2aQ9JJN4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Oxct2aQ9JJN4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Oxct2aQ9JJN4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Oxct2aQ9JJN4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Oxct2aQ9JJN4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Oxct2aQ9JJN4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Oxct2aQ9JJN4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Oxct2aQ9JJN4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Oxct2aQ9JJN4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Oxct2aQ9JJN4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Oxct2aQ9JJN4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Oxct2aQ9JJN4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Oxct2aQ9JJN4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Oxct2aQ9JJN4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Oxct2aQ9JJN4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Oxct2aQ9JJN4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Oxct2aQ9JJN4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Oxct2aQ9JJN4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Oxct2aQ9JJN4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Oxct2aQ9JJN4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Oxct2aQ9JJN4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Oxct2aQ9JJN4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Oxct2aQ9JJN4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Oxct2aQ9JJN4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Oxct2aQ9JJN4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Oxct2aQ9JJN4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Oxct2aQ9JJN4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Oxct2aQ9JJN4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Oxct2aQ9JJN4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Oxct2aQ9JJN4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Oxct2aQ9JJN4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Oxct2aQ9JJN4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Oxct2aQ9JJN4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Oxct2aQ9JJN4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Oxct2aQ9JJN4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Oxct2aQ9JJN4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Oxct2aQ9JJN4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Oxct2aQ9JJN4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Oxct2aQ9JJN4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Oxct2aQ9JJN4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Oxct2aQ9JJN4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Oxct2aQ9JJN4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Oxct2aQ9JJN4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Oxct2aQ9JJN4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Oxct2aQ9JJN4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Oxct2aQ9JJN4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Oxct2aQ9JJN4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Oxct2aQ9JJN4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Oxct2aQ9JJN4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Oxct2aQ9JJN4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Oxct2aQ9JJN4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Oxct2aQ9JJN4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Oxct2aQ9JJN4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Oxct2aQ9JJN4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Oxct2aQ9JJN4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Oxct2aQ9JJN4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Oxct2aQ9JJN4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Oxct2aQ9JJN4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Oxct2aQ9JJN4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Oxct2aQ9JJN4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Oxct2aQ9JJN4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Oxct2aQ9JJN4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Oxct2aQ9JJN4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Oxct2aQ9JJN4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Oxct2aQ9JJN4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Oxct2aQ9JJN4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Oxct2aQ9JJN4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Oxct2aQ9JJN4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Oxct2aQ9JJN4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Oxct2aQ9JJN4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Oxct2aQ9JJN4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Oxct2aQ9JJN4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Oxct2aQ9JJN4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Oxct2aQ9JJN4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Oxct2aQ9JJN4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Oxct2aQ9JJN4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Oxct2aQ9JJN4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.5 ms