Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHW4

Eefsec, Selenocysteine-specific elongation factor, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EefsecQ9JHW4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EefsecQ9JHW4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EefsecQ9JHW4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EefsecQ9JHW4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
EefsecQ9JHW4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
EefsecQ9JHW4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
EefsecQ9JHW4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EefsecQ9JHW4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EefsecQ9JHW4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EefsecQ9JHW4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EefsecQ9JHW4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EefsecQ9JHW4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EefsecQ9JHW4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EefsecQ9JHW4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
EefsecQ9JHW4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EefsecQ9JHW4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EefsecQ9JHW4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EefsecQ9JHW4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EefsecQ9JHW4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EefsecQ9JHW4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EefsecQ9JHW4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EefsecQ9JHW4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EefsecQ9JHW4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EefsecQ9JHW4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EefsecQ9JHW4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EefsecQ9JHW4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EefsecQ9JHW4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EefsecQ9JHW4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
EefsecQ9JHW4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
EefsecQ9JHW4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EefsecQ9JHW4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EefsecQ9JHW4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EefsecQ9JHW4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EefsecQ9JHW4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EefsecQ9JHW4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
EefsecQ9JHW4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EefsecQ9JHW4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
EefsecQ9JHW4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EefsecQ9JHW4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
EefsecQ9JHW4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EefsecQ9JHW4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EefsecQ9JHW4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EefsecQ9JHW4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EefsecQ9JHW4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EefsecQ9JHW4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EefsecQ9JHW4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EefsecQ9JHW4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
EefsecQ9JHW4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EefsecQ9JHW4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EefsecQ9JHW4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EefsecQ9JHW4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EefsecQ9JHW4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EefsecQ9JHW4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EefsecQ9JHW4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EefsecQ9JHW4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EefsecQ9JHW4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EefsecQ9JHW4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EefsecQ9JHW4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EefsecQ9JHW4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EefsecQ9JHW4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
EefsecQ9JHW4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
EefsecQ9JHW4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EefsecQ9JHW4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EefsecQ9JHW4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
EefsecQ9JHW4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EefsecQ9JHW4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EefsecQ9JHW4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EefsecQ9JHW4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EefsecQ9JHW4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EefsecQ9JHW4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EefsecQ9JHW4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EefsecQ9JHW4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EefsecQ9JHW4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EefsecQ9JHW4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EefsecQ9JHW4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EefsecQ9JHW4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EefsecQ9JHW4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EefsecQ9JHW4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
EefsecQ9JHW4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EefsecQ9JHW4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EefsecQ9JHW4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EefsecQ9JHW4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EefsecQ9JHW4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EefsecQ9JHW4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EefsecQ9JHW4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EefsecQ9JHW4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EefsecQ9JHW4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EefsecQ9JHW4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
EefsecQ9JHW4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EefsecQ9JHW4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EefsecQ9JHW4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EefsecQ9JHW4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EefsecQ9JHW4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EefsecQ9JHW4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EefsecQ9JHW4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EefsecQ9JHW4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EefsecQ9JHW4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EefsecQ9JHW4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EefsecQ9JHW4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EefsecQ9JHW4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.5 ms