Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES97

Rtn3, Reticulon-3, mousemouse

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Length 964 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn3Q9ES97 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rtn3Q9ES97 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rtn3Q9ES97 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rtn3Q9ES97 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rtn3Q9ES97 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rtn3Q9ES97 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rtn3Q9ES97 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rtn3Q9ES97 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rtn3Q9ES97 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Rtn3Q9ES97 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rtn3Q9ES97 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rtn3Q9ES97 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rtn3Q9ES97 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rtn3Q9ES97 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rtn3Q9ES97 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rtn3Q9ES97 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rtn3Q9ES97 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rtn3Q9ES97 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rtn3Q9ES97 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rtn3Q9ES97 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rtn3Q9ES97 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rtn3Q9ES97 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rtn3Q9ES97 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rtn3Q9ES97 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rtn3Q9ES97 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rtn3Q9ES97 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rtn3Q9ES97 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rtn3Q9ES97 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rtn3Q9ES97 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rtn3Q9ES97 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rtn3Q9ES97 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rtn3Q9ES97 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rtn3Q9ES97 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rtn3Q9ES97 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rtn3Q9ES97 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rtn3Q9ES97 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rtn3Q9ES97 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rtn3Q9ES97 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rtn3Q9ES97 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rtn3Q9ES97 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rtn3Q9ES97 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rtn3Q9ES97 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rtn3Q9ES97 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rtn3Q9ES97 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rtn3Q9ES97 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rtn3Q9ES97 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rtn3Q9ES97 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rtn3Q9ES97 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rtn3Q9ES97 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rtn3Q9ES97 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rtn3Q9ES97 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Rtn3Q9ES97 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rtn3Q9ES97 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rtn3Q9ES97 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rtn3Q9ES97 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rtn3Q9ES97 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rtn3Q9ES97 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rtn3Q9ES97 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rtn3Q9ES97 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rtn3Q9ES97 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rtn3Q9ES97 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rtn3Q9ES97 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Rtn3Q9ES97 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rtn3Q9ES97 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Rtn3Q9ES97 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rtn3Q9ES97 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rtn3Q9ES97 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rtn3Q9ES97 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rtn3Q9ES97 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rtn3Q9ES97 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rtn3Q9ES97 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Rtn3Q9ES97 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rtn3Q9ES97 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rtn3Q9ES97 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rtn3Q9ES97 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rtn3Q9ES97 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rtn3Q9ES97 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rtn3Q9ES97 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rtn3Q9ES97 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rtn3Q9ES97 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rtn3Q9ES97 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rtn3Q9ES97 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Rtn3Q9ES97 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rtn3Q9ES97 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rtn3Q9ES97 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Rtn3Q9ES97 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rtn3Q9ES97 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rtn3Q9ES97 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rtn3Q9ES97 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rtn3Q9ES97 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rtn3Q9ES97 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rtn3Q9ES97 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rtn3Q9ES97 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rtn3Q9ES97 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rtn3Q9ES97 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Rtn3Q9ES97 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rtn3Q9ES97 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rtn3Q9ES97 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rtn3Q9ES97 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rtn3Q9ES97 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms