Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCZ9

Aph1c, Putative gamma-secretase subunit APH-1C, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aph1cQ9DCZ9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Aph1cQ9DCZ9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Aph1cQ9DCZ9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Aph1cQ9DCZ9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Aph1cQ9DCZ9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Aph1cQ9DCZ9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Aph1cQ9DCZ9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Aph1cQ9DCZ9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Aph1cQ9DCZ9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Aph1cQ9DCZ9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Aph1cQ9DCZ9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Aph1cQ9DCZ9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Aph1cQ9DCZ9 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Aph1cQ9DCZ9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Aph1cQ9DCZ9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Aph1cQ9DCZ9 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Aph1cQ9DCZ9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Aph1cQ9DCZ9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Aph1cQ9DCZ9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Aph1cQ9DCZ9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Aph1cQ9DCZ9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Aph1cQ9DCZ9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Aph1cQ9DCZ9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Aph1cQ9DCZ9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Aph1cQ9DCZ9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Aph1cQ9DCZ9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Aph1cQ9DCZ9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Aph1cQ9DCZ9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Aph1cQ9DCZ9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Aph1cQ9DCZ9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Aph1cQ9DCZ9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Aph1cQ9DCZ9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Aph1cQ9DCZ9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Aph1cQ9DCZ9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Aph1cQ9DCZ9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Aph1cQ9DCZ9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Aph1cQ9DCZ9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Aph1cQ9DCZ9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Aph1cQ9DCZ9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Aph1cQ9DCZ9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Aph1cQ9DCZ9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Aph1cQ9DCZ9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Aph1cQ9DCZ9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Aph1cQ9DCZ9 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Aph1cQ9DCZ9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Aph1cQ9DCZ9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Aph1cQ9DCZ9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Aph1cQ9DCZ9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Aph1cQ9DCZ9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Aph1cQ9DCZ9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Aph1cQ9DCZ9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Aph1cQ9DCZ9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Aph1cQ9DCZ9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Aph1cQ9DCZ9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Aph1cQ9DCZ9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Aph1cQ9DCZ9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Aph1cQ9DCZ9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Aph1cQ9DCZ9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Aph1cQ9DCZ9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Aph1cQ9DCZ9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Aph1cQ9DCZ9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Aph1cQ9DCZ9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Aph1cQ9DCZ9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Aph1cQ9DCZ9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Aph1cQ9DCZ9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Aph1cQ9DCZ9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Aph1cQ9DCZ9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Aph1cQ9DCZ9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Aph1cQ9DCZ9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Aph1cQ9DCZ9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Aph1cQ9DCZ9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Aph1cQ9DCZ9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Aph1cQ9DCZ9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Aph1cQ9DCZ9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Aph1cQ9DCZ9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Aph1cQ9DCZ9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Aph1cQ9DCZ9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Aph1cQ9DCZ9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Aph1cQ9DCZ9 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Aph1cQ9DCZ9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Aph1cQ9DCZ9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Aph1cQ9DCZ9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Aph1cQ9DCZ9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Aph1cQ9DCZ9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Aph1cQ9DCZ9 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Aph1cQ9DCZ9 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Aph1cQ9DCZ9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Aph1cQ9DCZ9 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Aph1cQ9DCZ9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Aph1cQ9DCZ9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Aph1cQ9DCZ9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Aph1cQ9DCZ9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Aph1cQ9DCZ9 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Aph1cQ9DCZ9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Aph1cQ9DCZ9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Aph1cQ9DCZ9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Aph1cQ9DCZ9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Aph1cQ9DCZ9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Aph1cQ9DCZ9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Aph1cQ9DCZ9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.9 ms