Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan4Q9DCK3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tspan4Q9DCK3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tspan4Q9DCK3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tspan4Q9DCK3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tspan4Q9DCK3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tspan4Q9DCK3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tspan4Q9DCK3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tspan4Q9DCK3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tspan4Q9DCK3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tspan4Q9DCK3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tspan4Q9DCK3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Tspan4Q9DCK3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tspan4Q9DCK3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tspan4Q9DCK3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tspan4Q9DCK3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tspan4Q9DCK3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tspan4Q9DCK3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tspan4Q9DCK3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tspan4Q9DCK3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tspan4Q9DCK3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tspan4Q9DCK3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tspan4Q9DCK3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tspan4Q9DCK3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tspan4Q9DCK3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tspan4Q9DCK3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tspan4Q9DCK3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tspan4Q9DCK3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tspan4Q9DCK3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tspan4Q9DCK3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tspan4Q9DCK3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tspan4Q9DCK3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tspan4Q9DCK3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tspan4Q9DCK3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tspan4Q9DCK3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tspan4Q9DCK3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tspan4Q9DCK3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tspan4Q9DCK3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tspan4Q9DCK3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tspan4Q9DCK3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tspan4Q9DCK3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tspan4Q9DCK3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tspan4Q9DCK3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tspan4Q9DCK3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tspan4Q9DCK3 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tspan4Q9DCK3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tspan4Q9DCK3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tspan4Q9DCK3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tspan4Q9DCK3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tspan4Q9DCK3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tspan4Q9DCK3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tspan4Q9DCK3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tspan4Q9DCK3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tspan4Q9DCK3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tspan4Q9DCK3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tspan4Q9DCK3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tspan4Q9DCK3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tspan4Q9DCK3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tspan4Q9DCK3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tspan4Q9DCK3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tspan4Q9DCK3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tspan4Q9DCK3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tspan4Q9DCK3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tspan4Q9DCK3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tspan4Q9DCK3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tspan4Q9DCK3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tspan4Q9DCK3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Tspan4Q9DCK3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tspan4Q9DCK3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tspan4Q9DCK3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tspan4Q9DCK3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tspan4Q9DCK3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tspan4Q9DCK3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tspan4Q9DCK3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tspan4Q9DCK3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tspan4Q9DCK3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tspan4Q9DCK3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tspan4Q9DCK3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tspan4Q9DCK3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tspan4Q9DCK3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tspan4Q9DCK3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tspan4Q9DCK3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tspan4Q9DCK3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tspan4Q9DCK3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tspan4Q9DCK3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tspan4Q9DCK3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tspan4Q9DCK3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tspan4Q9DCK3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tspan4Q9DCK3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Tspan4Q9DCK3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tspan4Q9DCK3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tspan4Q9DCK3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tspan4Q9DCK3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tspan4Q9DCK3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tspan4Q9DCK3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Tspan4Q9DCK3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tspan4Q9DCK3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tspan4Q9DCK3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tspan4Q9DCK3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tspan4Q9DCK3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tspan4Q9DCK3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.8 ms