Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA42

Uncharacterized protein C20orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DA42 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q9DA42 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q9DA42 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Q9DA42 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q9DA42 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q9DA42 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q9DA42 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q9DA42 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q9DA42 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q9DA42 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q9DA42 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q9DA42 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q9DA42 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q9DA42 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q9DA42 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q9DA42 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q9DA42 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q9DA42 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q9DA42 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q9DA42 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q9DA42 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q9DA42 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q9DA42 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q9DA42 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q9DA42 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q9DA42 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q9DA42 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q9DA42 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q9DA42 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q9DA42 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q9DA42 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q9DA42 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q9DA42 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q9DA42 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q9DA42 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Q9DA42 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q9DA42 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q9DA42 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q9DA42 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q9DA42 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q9DA42 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q9DA42 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q9DA42 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q9DA42 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Q9DA42 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Q9DA42 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Q9DA42 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q9DA42 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q9DA42 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Q9DA42 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Q9DA42 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q9DA42 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q9DA42 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q9DA42 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q9DA42 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q9DA42 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q9DA42 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q9DA42 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q9DA42 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q9DA42 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q9DA42 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q9DA42 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q9DA42 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q9DA42 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q9DA42 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q9DA42 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q9DA42 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q9DA42 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q9DA42 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q9DA42 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q9DA42 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q9DA42 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Q9DA42 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q9DA42 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q9DA42 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q9DA42 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q9DA42 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q9DA42 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q9DA42 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q9DA42 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q9DA42 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q9DA42 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q9DA42 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q9DA42 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q9DA42 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q9DA42 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Q9DA42 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q9DA42 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q9DA42 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q9DA42 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q9DA42 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q9DA42 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q9DA42 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q9DA42 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q9DA42 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q9DA42 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q9DA42 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q9DA42 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q9DA42 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Q9DA42 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms