Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8W5

Psmd12, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd12Q9D8W5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Psmd12Q9D8W5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Psmd12Q9D8W5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Psmd12Q9D8W5 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Psmd12Q9D8W5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Psmd12Q9D8W5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Psmd12Q9D8W5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Psmd12Q9D8W5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Psmd12Q9D8W5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Psmd12Q9D8W5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Psmd12Q9D8W5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Psmd12Q9D8W5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Psmd12Q9D8W5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Psmd12Q9D8W5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Psmd12Q9D8W5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Psmd12Q9D8W5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Psmd12Q9D8W5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Psmd12Q9D8W5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Psmd12Q9D8W5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Psmd12Q9D8W5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Psmd12Q9D8W5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Psmd12Q9D8W5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Psmd12Q9D8W5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Psmd12Q9D8W5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Psmd12Q9D8W5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Psmd12Q9D8W5 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Psmd12Q9D8W5 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Psmd12Q9D8W5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Psmd12Q9D8W5 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Psmd12Q9D8W5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Psmd12Q9D8W5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Psmd12Q9D8W5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Psmd12Q9D8W5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Psmd12Q9D8W5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Psmd12Q9D8W5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Psmd12Q9D8W5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Psmd12Q9D8W5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Psmd12Q9D8W5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Psmd12Q9D8W5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Psmd12Q9D8W5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Psmd12Q9D8W5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Psmd12Q9D8W5 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Psmd12Q9D8W5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Psmd12Q9D8W5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Psmd12Q9D8W5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Psmd12Q9D8W5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Psmd12Q9D8W5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Psmd12Q9D8W5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Psmd12Q9D8W5 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Psmd12Q9D8W5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Psmd12Q9D8W5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Psmd12Q9D8W5 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Psmd12Q9D8W5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Psmd12Q9D8W5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Psmd12Q9D8W5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Psmd12Q9D8W5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Psmd12Q9D8W5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Psmd12Q9D8W5 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Psmd12Q9D8W5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Psmd12Q9D8W5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Psmd12Q9D8W5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Psmd12Q9D8W5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Psmd12Q9D8W5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Psmd12Q9D8W5 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Psmd12Q9D8W5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Psmd12Q9D8W5 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Psmd12Q9D8W5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Psmd12Q9D8W5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Psmd12Q9D8W5 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Psmd12Q9D8W5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Psmd12Q9D8W5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Psmd12Q9D8W5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Psmd12Q9D8W5 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Psmd12Q9D8W5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Psmd12Q9D8W5 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Psmd12Q9D8W5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Psmd12Q9D8W5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Psmd12Q9D8W5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Psmd12Q9D8W5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Psmd12Q9D8W5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Psmd12Q9D8W5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Psmd12Q9D8W5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Psmd12Q9D8W5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Psmd12Q9D8W5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Psmd12Q9D8W5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Psmd12Q9D8W5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Psmd12Q9D8W5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Psmd12Q9D8W5 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Psmd12Q9D8W5 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Psmd12Q9D8W5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Psmd12Q9D8W5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Psmd12Q9D8W5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Psmd12Q9D8W5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Psmd12Q9D8W5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Psmd12Q9D8W5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Psmd12Q9D8W5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Psmd12Q9D8W5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Psmd12Q9D8W5 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Psmd12Q9D8W5 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Psmd12Q9D8W5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms