Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8S4

Rexo2, Oligoribonuclease, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo2Q9D8S4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rexo2Q9D8S4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rexo2Q9D8S4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rexo2Q9D8S4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Rexo2Q9D8S4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rexo2Q9D8S4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rexo2Q9D8S4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rexo2Q9D8S4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rexo2Q9D8S4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rexo2Q9D8S4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rexo2Q9D8S4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Rexo2Q9D8S4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rexo2Q9D8S4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rexo2Q9D8S4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rexo2Q9D8S4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rexo2Q9D8S4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rexo2Q9D8S4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Rexo2Q9D8S4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rexo2Q9D8S4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rexo2Q9D8S4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rexo2Q9D8S4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rexo2Q9D8S4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rexo2Q9D8S4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rexo2Q9D8S4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rexo2Q9D8S4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rexo2Q9D8S4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rexo2Q9D8S4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rexo2Q9D8S4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rexo2Q9D8S4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rexo2Q9D8S4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rexo2Q9D8S4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rexo2Q9D8S4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rexo2Q9D8S4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rexo2Q9D8S4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rexo2Q9D8S4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rexo2Q9D8S4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rexo2Q9D8S4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rexo2Q9D8S4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rexo2Q9D8S4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rexo2Q9D8S4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rexo2Q9D8S4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rexo2Q9D8S4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rexo2Q9D8S4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rexo2Q9D8S4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rexo2Q9D8S4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rexo2Q9D8S4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rexo2Q9D8S4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rexo2Q9D8S4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rexo2Q9D8S4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rexo2Q9D8S4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rexo2Q9D8S4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rexo2Q9D8S4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rexo2Q9D8S4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rexo2Q9D8S4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Rexo2Q9D8S4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rexo2Q9D8S4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Rexo2Q9D8S4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rexo2Q9D8S4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rexo2Q9D8S4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Rexo2Q9D8S4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rexo2Q9D8S4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rexo2Q9D8S4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rexo2Q9D8S4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rexo2Q9D8S4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rexo2Q9D8S4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Rexo2Q9D8S4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rexo2Q9D8S4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rexo2Q9D8S4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rexo2Q9D8S4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rexo2Q9D8S4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rexo2Q9D8S4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rexo2Q9D8S4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rexo2Q9D8S4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rexo2Q9D8S4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Rexo2Q9D8S4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rexo2Q9D8S4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rexo2Q9D8S4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rexo2Q9D8S4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rexo2Q9D8S4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rexo2Q9D8S4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rexo2Q9D8S4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rexo2Q9D8S4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rexo2Q9D8S4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rexo2Q9D8S4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Rexo2Q9D8S4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rexo2Q9D8S4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rexo2Q9D8S4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rexo2Q9D8S4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rexo2Q9D8S4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rexo2Q9D8S4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rexo2Q9D8S4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rexo2Q9D8S4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rexo2Q9D8S4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rexo2Q9D8S4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rexo2Q9D8S4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rexo2Q9D8S4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rexo2Q9D8S4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rexo2Q9D8S4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rexo2Q9D8S4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rexo2Q9D8S4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms