Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6G9

Cmtm5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm5Q9D6G9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cmtm5Q9D6G9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cmtm5Q9D6G9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cmtm5Q9D6G9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Cmtm5Q9D6G9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cmtm5Q9D6G9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cmtm5Q9D6G9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cmtm5Q9D6G9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cmtm5Q9D6G9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Cmtm5Q9D6G9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cmtm5Q9D6G9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cmtm5Q9D6G9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Cmtm5Q9D6G9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cmtm5Q9D6G9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cmtm5Q9D6G9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cmtm5Q9D6G9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cmtm5Q9D6G9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cmtm5Q9D6G9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cmtm5Q9D6G9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cmtm5Q9D6G9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cmtm5Q9D6G9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cmtm5Q9D6G9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Cmtm5Q9D6G9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cmtm5Q9D6G9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cmtm5Q9D6G9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cmtm5Q9D6G9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cmtm5Q9D6G9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cmtm5Q9D6G9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cmtm5Q9D6G9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cmtm5Q9D6G9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cmtm5Q9D6G9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cmtm5Q9D6G9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cmtm5Q9D6G9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cmtm5Q9D6G9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cmtm5Q9D6G9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cmtm5Q9D6G9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Cmtm5Q9D6G9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cmtm5Q9D6G9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cmtm5Q9D6G9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cmtm5Q9D6G9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cmtm5Q9D6G9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cmtm5Q9D6G9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cmtm5Q9D6G9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cmtm5Q9D6G9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cmtm5Q9D6G9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cmtm5Q9D6G9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cmtm5Q9D6G9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cmtm5Q9D6G9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cmtm5Q9D6G9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cmtm5Q9D6G9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cmtm5Q9D6G9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cmtm5Q9D6G9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cmtm5Q9D6G9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cmtm5Q9D6G9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cmtm5Q9D6G9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Cmtm5Q9D6G9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cmtm5Q9D6G9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cmtm5Q9D6G9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cmtm5Q9D6G9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cmtm5Q9D6G9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cmtm5Q9D6G9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cmtm5Q9D6G9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cmtm5Q9D6G9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cmtm5Q9D6G9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cmtm5Q9D6G9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cmtm5Q9D6G9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cmtm5Q9D6G9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cmtm5Q9D6G9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cmtm5Q9D6G9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cmtm5Q9D6G9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cmtm5Q9D6G9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cmtm5Q9D6G9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cmtm5Q9D6G9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cmtm5Q9D6G9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cmtm5Q9D6G9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cmtm5Q9D6G9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cmtm5Q9D6G9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cmtm5Q9D6G9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cmtm5Q9D6G9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cmtm5Q9D6G9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cmtm5Q9D6G9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Cmtm5Q9D6G9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cmtm5Q9D6G9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Cmtm5Q9D6G9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cmtm5Q9D6G9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Cmtm5Q9D6G9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cmtm5Q9D6G9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cmtm5Q9D6G9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cmtm5Q9D6G9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cmtm5Q9D6G9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cmtm5Q9D6G9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cmtm5Q9D6G9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cmtm5Q9D6G9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cmtm5Q9D6G9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Cmtm5Q9D6G9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cmtm5Q9D6G9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cmtm5Q9D6G9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cmtm5Q9D6G9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cmtm5Q9D6G9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cmtm5Q9D6G9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms