Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4D5

4933414I15Rik, RIKEN cDNA 4933414I15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933414I15RikQ9D4D5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4933414I15RikQ9D4D5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4933414I15RikQ9D4D5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4933414I15RikQ9D4D5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4933414I15RikQ9D4D5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4933414I15RikQ9D4D5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4933414I15RikQ9D4D5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
4933414I15RikQ9D4D5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
4933414I15RikQ9D4D5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4933414I15RikQ9D4D5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4933414I15RikQ9D4D5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
4933414I15RikQ9D4D5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4933414I15RikQ9D4D5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
4933414I15RikQ9D4D5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
4933414I15RikQ9D4D5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
4933414I15RikQ9D4D5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
4933414I15RikQ9D4D5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
4933414I15RikQ9D4D5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
4933414I15RikQ9D4D5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
4933414I15RikQ9D4D5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
4933414I15RikQ9D4D5 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
4933414I15RikQ9D4D5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4933414I15RikQ9D4D5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
4933414I15RikQ9D4D5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4933414I15RikQ9D4D5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4933414I15RikQ9D4D5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4933414I15RikQ9D4D5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4933414I15RikQ9D4D5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
4933414I15RikQ9D4D5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4933414I15RikQ9D4D5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4933414I15RikQ9D4D5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4933414I15RikQ9D4D5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
4933414I15RikQ9D4D5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4933414I15RikQ9D4D5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4933414I15RikQ9D4D5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4933414I15RikQ9D4D5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
4933414I15RikQ9D4D5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4933414I15RikQ9D4D5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
4933414I15RikQ9D4D5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4933414I15RikQ9D4D5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4933414I15RikQ9D4D5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
4933414I15RikQ9D4D5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
4933414I15RikQ9D4D5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4933414I15RikQ9D4D5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
4933414I15RikQ9D4D5 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4933414I15RikQ9D4D5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
4933414I15RikQ9D4D5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4933414I15RikQ9D4D5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4933414I15RikQ9D4D5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4933414I15RikQ9D4D5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4933414I15RikQ9D4D5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4933414I15RikQ9D4D5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4933414I15RikQ9D4D5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4933414I15RikQ9D4D5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4933414I15RikQ9D4D5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4933414I15RikQ9D4D5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4933414I15RikQ9D4D5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4933414I15RikQ9D4D5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4933414I15RikQ9D4D5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4933414I15RikQ9D4D5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4933414I15RikQ9D4D5 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4933414I15RikQ9D4D5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4933414I15RikQ9D4D5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4933414I15RikQ9D4D5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
4933414I15RikQ9D4D5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4933414I15RikQ9D4D5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4933414I15RikQ9D4D5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4933414I15RikQ9D4D5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
4933414I15RikQ9D4D5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4933414I15RikQ9D4D5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4933414I15RikQ9D4D5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
4933414I15RikQ9D4D5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4933414I15RikQ9D4D5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4933414I15RikQ9D4D5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
4933414I15RikQ9D4D5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4933414I15RikQ9D4D5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4933414I15RikQ9D4D5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4933414I15RikQ9D4D5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4933414I15RikQ9D4D5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
4933414I15RikQ9D4D5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4933414I15RikQ9D4D5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4933414I15RikQ9D4D5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4933414I15RikQ9D4D5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
4933414I15RikQ9D4D5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
4933414I15RikQ9D4D5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
4933414I15RikQ9D4D5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
4933414I15RikQ9D4D5 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4933414I15RikQ9D4D5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4933414I15RikQ9D4D5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4933414I15RikQ9D4D5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
4933414I15RikQ9D4D5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4933414I15RikQ9D4D5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4933414I15RikQ9D4D5 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
4933414I15RikQ9D4D5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4933414I15RikQ9D4D5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4933414I15RikQ9D4D5 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4933414I15RikQ9D4D5 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4933414I15RikQ9D4D5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4933414I15RikQ9D4D5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4933414I15RikQ9D4D5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms