Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3F6

Ms4a4c, MCG12897, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4cQ9D3F6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ms4a4cQ9D3F6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ms4a4cQ9D3F6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ms4a4cQ9D3F6 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ms4a4cQ9D3F6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ms4a4cQ9D3F6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ms4a4cQ9D3F6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ms4a4cQ9D3F6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ms4a4cQ9D3F6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ms4a4cQ9D3F6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ms4a4cQ9D3F6 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ms4a4cQ9D3F6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ms4a4cQ9D3F6 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ms4a4cQ9D3F6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ms4a4cQ9D3F6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ms4a4cQ9D3F6 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ms4a4cQ9D3F6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ms4a4cQ9D3F6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ms4a4cQ9D3F6 Gm37083-201ENSMUST00000195784 711 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ms4a4cQ9D3F6 Gm11361-201ENSMUST00000223428 607 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ms4a4cQ9D3F6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ms4a4cQ9D3F6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ms4a4cQ9D3F6 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ms4a4cQ9D3F6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ms4a4cQ9D3F6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ms4a4cQ9D3F6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ms4a4cQ9D3F6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ms4a4cQ9D3F6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ms4a4cQ9D3F6 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ms4a4cQ9D3F6 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ms4a4cQ9D3F6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ms4a4cQ9D3F6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ms4a4cQ9D3F6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ms4a4cQ9D3F6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ms4a4cQ9D3F6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ms4a4cQ9D3F6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ms4a4cQ9D3F6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ms4a4cQ9D3F6 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ms4a4cQ9D3F6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ms4a4cQ9D3F6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ms4a4cQ9D3F6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ms4a4cQ9D3F6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ms4a4cQ9D3F6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ms4a4cQ9D3F6 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ms4a4cQ9D3F6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ms4a4cQ9D3F6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ms4a4cQ9D3F6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ms4a4cQ9D3F6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ms4a4cQ9D3F6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ms4a4cQ9D3F6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ms4a4cQ9D3F6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ms4a4cQ9D3F6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ms4a4cQ9D3F6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ms4a4cQ9D3F6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ms4a4cQ9D3F6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ms4a4cQ9D3F6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ms4a4cQ9D3F6 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ms4a4cQ9D3F6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ms4a4cQ9D3F6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ms4a4cQ9D3F6 Clec4d-201ENSMUST00000032240 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ms4a4cQ9D3F6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ms4a4cQ9D3F6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ms4a4cQ9D3F6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ms4a4cQ9D3F6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ms4a4cQ9D3F6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ms4a4cQ9D3F6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ms4a4cQ9D3F6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ms4a4cQ9D3F6 Gm21156-201ENSMUST00000189693 869 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ms4a4cQ9D3F6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ms4a4cQ9D3F6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ms4a4cQ9D3F6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ms4a4cQ9D3F6 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ms4a4cQ9D3F6 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ms4a4cQ9D3F6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ms4a4cQ9D3F6 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ms4a4cQ9D3F6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ms4a4cQ9D3F6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ms4a4cQ9D3F6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ms4a4cQ9D3F6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ms4a4cQ9D3F6 Gm32390-201ENSMUST00000212713 1172 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ms4a4cQ9D3F6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ms4a4cQ9D3F6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ms4a4cQ9D3F6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ms4a4cQ9D3F6 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ms4a4cQ9D3F6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ms4a4cQ9D3F6 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ms4a4cQ9D3F6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ms4a4cQ9D3F6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ms4a4cQ9D3F6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ms4a4cQ9D3F6 Gm20865-201ENSMUST00000179095 856 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ms4a4cQ9D3F6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ms4a4cQ9D3F6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ms4a4cQ9D3F6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ms4a4cQ9D3F6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ms4a4cQ9D3F6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ms4a4cQ9D3F6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ms4a4cQ9D3F6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ms4a4cQ9D3F6 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ms4a4cQ9D3F6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ms4a4cQ9D3F6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms