Protein–RNA interactions for Protein: Q9D350

Obox1, OBOX1, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Obox1Q9D350 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Obox1Q9D350 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
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Obox1Q9D350 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Obox1Q9D350 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Obox1Q9D350 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Obox1Q9D350 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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Obox1Q9D350 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Obox1Q9D350 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Obox1Q9D350 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Obox1Q9D350 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Obox1Q9D350 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Obox1Q9D350 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Obox1Q9D350 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Obox1Q9D350 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Obox1Q9D350 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Obox1Q9D350 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Obox1Q9D350 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Obox1Q9D350 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Obox1Q9D350 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Obox1Q9D350 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Obox1Q9D350 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Obox1Q9D350 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Obox1Q9D350 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Obox1Q9D350 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Obox1Q9D350 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Obox1Q9D350 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Obox1Q9D350 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Obox1Q9D350 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Obox1Q9D350 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Obox1Q9D350 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Obox1Q9D350 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Obox1Q9D350 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Obox1Q9D350 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms