Protein–RNA interactions for Protein: Q9D300

Rasgef1c, Ras-GEF domain-containing family member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1cQ9D300 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rasgef1cQ9D300 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rasgef1cQ9D300 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rasgef1cQ9D300 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rasgef1cQ9D300 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rasgef1cQ9D300 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Rasgef1cQ9D300 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rasgef1cQ9D300 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rasgef1cQ9D300 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rasgef1cQ9D300 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Rasgef1cQ9D300 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rasgef1cQ9D300 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rasgef1cQ9D300 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rasgef1cQ9D300 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rasgef1cQ9D300 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rasgef1cQ9D300 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rasgef1cQ9D300 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Rasgef1cQ9D300 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rasgef1cQ9D300 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Rasgef1cQ9D300 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rasgef1cQ9D300 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rasgef1cQ9D300 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rasgef1cQ9D300 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rasgef1cQ9D300 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rasgef1cQ9D300 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rasgef1cQ9D300 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rasgef1cQ9D300 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rasgef1cQ9D300 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rasgef1cQ9D300 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rasgef1cQ9D300 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rasgef1cQ9D300 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rasgef1cQ9D300 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rasgef1cQ9D300 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rasgef1cQ9D300 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rasgef1cQ9D300 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rasgef1cQ9D300 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rasgef1cQ9D300 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rasgef1cQ9D300 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rasgef1cQ9D300 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rasgef1cQ9D300 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rasgef1cQ9D300 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rasgef1cQ9D300 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rasgef1cQ9D300 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rasgef1cQ9D300 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rasgef1cQ9D300 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rasgef1cQ9D300 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rasgef1cQ9D300 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rasgef1cQ9D300 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rasgef1cQ9D300 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rasgef1cQ9D300 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rasgef1cQ9D300 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Rasgef1cQ9D300 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rasgef1cQ9D300 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rasgef1cQ9D300 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rasgef1cQ9D300 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rasgef1cQ9D300 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rasgef1cQ9D300 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rasgef1cQ9D300 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rasgef1cQ9D300 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Rasgef1cQ9D300 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rasgef1cQ9D300 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rasgef1cQ9D300 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rasgef1cQ9D300 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rasgef1cQ9D300 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rasgef1cQ9D300 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rasgef1cQ9D300 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rasgef1cQ9D300 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rasgef1cQ9D300 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rasgef1cQ9D300 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rasgef1cQ9D300 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rasgef1cQ9D300 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Rasgef1cQ9D300 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rasgef1cQ9D300 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rasgef1cQ9D300 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rasgef1cQ9D300 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rasgef1cQ9D300 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rasgef1cQ9D300 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rasgef1cQ9D300 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rasgef1cQ9D300 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rasgef1cQ9D300 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rasgef1cQ9D300 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rasgef1cQ9D300 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rasgef1cQ9D300 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rasgef1cQ9D300 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rasgef1cQ9D300 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rasgef1cQ9D300 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rasgef1cQ9D300 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rasgef1cQ9D300 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rasgef1cQ9D300 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rasgef1cQ9D300 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rasgef1cQ9D300 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rasgef1cQ9D300 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Rasgef1cQ9D300 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rasgef1cQ9D300 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rasgef1cQ9D300 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rasgef1cQ9D300 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rasgef1cQ9D300 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rasgef1cQ9D300 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rasgef1cQ9D300 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rasgef1cQ9D300 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms