Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2R4

Tmed11, Transmembrane emp24 domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed11Q9D2R4 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tmed11Q9D2R4 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tmed11Q9D2R4 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tmed11Q9D2R4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tmed11Q9D2R4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tmed11Q9D2R4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tmed11Q9D2R4 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tmed11Q9D2R4 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tmed11Q9D2R4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tmed11Q9D2R4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tmed11Q9D2R4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tmed11Q9D2R4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tmed11Q9D2R4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tmed11Q9D2R4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tmed11Q9D2R4 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tmed11Q9D2R4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tmed11Q9D2R4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tmed11Q9D2R4 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tmed11Q9D2R4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Tmed11Q9D2R4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tmed11Q9D2R4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tmed11Q9D2R4 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tmed11Q9D2R4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tmed11Q9D2R4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tmed11Q9D2R4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Tmed11Q9D2R4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tmed11Q9D2R4 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tmed11Q9D2R4 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tmed11Q9D2R4 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tmed11Q9D2R4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tmed11Q9D2R4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tmed11Q9D2R4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tmed11Q9D2R4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tmed11Q9D2R4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tmed11Q9D2R4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tmed11Q9D2R4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tmed11Q9D2R4 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tmed11Q9D2R4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tmed11Q9D2R4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tmed11Q9D2R4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tmed11Q9D2R4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tmed11Q9D2R4 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tmed11Q9D2R4 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tmed11Q9D2R4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tmed11Q9D2R4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tmed11Q9D2R4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tmed11Q9D2R4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tmed11Q9D2R4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tmed11Q9D2R4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tmed11Q9D2R4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tmed11Q9D2R4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tmed11Q9D2R4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tmed11Q9D2R4 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tmed11Q9D2R4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tmed11Q9D2R4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tmed11Q9D2R4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tmed11Q9D2R4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tmed11Q9D2R4 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tmed11Q9D2R4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tmed11Q9D2R4 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tmed11Q9D2R4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tmed11Q9D2R4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tmed11Q9D2R4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tmed11Q9D2R4 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tmed11Q9D2R4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tmed11Q9D2R4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tmed11Q9D2R4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tmed11Q9D2R4 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tmed11Q9D2R4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tmed11Q9D2R4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Tmed11Q9D2R4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tmed11Q9D2R4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tmed11Q9D2R4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tmed11Q9D2R4 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Tmed11Q9D2R4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Tmed11Q9D2R4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tmed11Q9D2R4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tmed11Q9D2R4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tmed11Q9D2R4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tmed11Q9D2R4 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tmed11Q9D2R4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tmed11Q9D2R4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tmed11Q9D2R4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tmed11Q9D2R4 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tmed11Q9D2R4 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tmed11Q9D2R4 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tmed11Q9D2R4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tmed11Q9D2R4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tmed11Q9D2R4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tmed11Q9D2R4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tmed11Q9D2R4 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Tmed11Q9D2R4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Tmed11Q9D2R4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tmed11Q9D2R4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tmed11Q9D2R4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tmed11Q9D2R4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tmed11Q9D2R4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tmed11Q9D2R4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tmed11Q9D2R4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Tmed11Q9D2R4 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms