Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F3

Lman1, Protein ERGIC-53, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lman1Q9D0F3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lman1Q9D0F3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lman1Q9D0F3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lman1Q9D0F3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lman1Q9D0F3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lman1Q9D0F3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lman1Q9D0F3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lman1Q9D0F3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lman1Q9D0F3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lman1Q9D0F3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lman1Q9D0F3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lman1Q9D0F3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lman1Q9D0F3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Lman1Q9D0F3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lman1Q9D0F3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lman1Q9D0F3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lman1Q9D0F3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lman1Q9D0F3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lman1Q9D0F3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lman1Q9D0F3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lman1Q9D0F3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lman1Q9D0F3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lman1Q9D0F3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Lman1Q9D0F3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lman1Q9D0F3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lman1Q9D0F3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lman1Q9D0F3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lman1Q9D0F3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lman1Q9D0F3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lman1Q9D0F3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lman1Q9D0F3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lman1Q9D0F3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lman1Q9D0F3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lman1Q9D0F3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lman1Q9D0F3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lman1Q9D0F3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lman1Q9D0F3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lman1Q9D0F3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lman1Q9D0F3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lman1Q9D0F3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lman1Q9D0F3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lman1Q9D0F3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lman1Q9D0F3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lman1Q9D0F3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Lman1Q9D0F3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lman1Q9D0F3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lman1Q9D0F3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lman1Q9D0F3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lman1Q9D0F3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lman1Q9D0F3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lman1Q9D0F3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lman1Q9D0F3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lman1Q9D0F3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lman1Q9D0F3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lman1Q9D0F3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lman1Q9D0F3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lman1Q9D0F3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lman1Q9D0F3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Lman1Q9D0F3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lman1Q9D0F3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lman1Q9D0F3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lman1Q9D0F3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lman1Q9D0F3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lman1Q9D0F3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lman1Q9D0F3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lman1Q9D0F3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lman1Q9D0F3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Lman1Q9D0F3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lman1Q9D0F3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lman1Q9D0F3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lman1Q9D0F3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lman1Q9D0F3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lman1Q9D0F3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Lman1Q9D0F3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lman1Q9D0F3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lman1Q9D0F3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lman1Q9D0F3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lman1Q9D0F3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lman1Q9D0F3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lman1Q9D0F3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lman1Q9D0F3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lman1Q9D0F3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lman1Q9D0F3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lman1Q9D0F3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lman1Q9D0F3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lman1Q9D0F3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lman1Q9D0F3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lman1Q9D0F3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lman1Q9D0F3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lman1Q9D0F3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lman1Q9D0F3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Lman1Q9D0F3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lman1Q9D0F3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lman1Q9D0F3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lman1Q9D0F3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lman1Q9D0F3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lman1Q9D0F3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lman1Q9D0F3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lman1Q9D0F3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lman1Q9D0F3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms