Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Snf8Q9CZ28 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snf8Q9CZ28 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snf8Q9CZ28 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snf8Q9CZ28 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snf8Q9CZ28 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snf8Q9CZ28 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snf8Q9CZ28 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snf8Q9CZ28 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snf8Q9CZ28 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snf8Q9CZ28 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snf8Q9CZ28 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Snf8Q9CZ28 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snf8Q9CZ28 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snf8Q9CZ28 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snf8Q9CZ28 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Snf8Q9CZ28 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snf8Q9CZ28 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snf8Q9CZ28 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snf8Q9CZ28 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Snf8Q9CZ28 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snf8Q9CZ28 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snf8Q9CZ28 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snf8Q9CZ28 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Snf8Q9CZ28 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snf8Q9CZ28 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snf8Q9CZ28 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snf8Q9CZ28 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snf8Q9CZ28 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snf8Q9CZ28 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snf8Q9CZ28 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snf8Q9CZ28 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snf8Q9CZ28 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snf8Q9CZ28 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Snf8Q9CZ28 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snf8Q9CZ28 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snf8Q9CZ28 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snf8Q9CZ28 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snf8Q9CZ28 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snf8Q9CZ28 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snf8Q9CZ28 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snf8Q9CZ28 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snf8Q9CZ28 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snf8Q9CZ28 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snf8Q9CZ28 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snf8Q9CZ28 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Snf8Q9CZ28 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Snf8Q9CZ28 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Snf8Q9CZ28 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snf8Q9CZ28 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snf8Q9CZ28 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snf8Q9CZ28 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snf8Q9CZ28 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Snf8Q9CZ28 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snf8Q9CZ28 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snf8Q9CZ28 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snf8Q9CZ28 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snf8Q9CZ28 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snf8Q9CZ28 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snf8Q9CZ28 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Snf8Q9CZ28 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snf8Q9CZ28 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snf8Q9CZ28 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snf8Q9CZ28 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snf8Q9CZ28 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snf8Q9CZ28 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snf8Q9CZ28 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snf8Q9CZ28 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snf8Q9CZ28 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snf8Q9CZ28 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snf8Q9CZ28 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snf8Q9CZ28 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Snf8Q9CZ28 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snf8Q9CZ28 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snf8Q9CZ28 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snf8Q9CZ28 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snf8Q9CZ28 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snf8Q9CZ28 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snf8Q9CZ28 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snf8Q9CZ28 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Snf8Q9CZ28 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snf8Q9CZ28 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snf8Q9CZ28 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snf8Q9CZ28 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snf8Q9CZ28 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snf8Q9CZ28 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snf8Q9CZ28 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snf8Q9CZ28 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snf8Q9CZ28 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snf8Q9CZ28 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snf8Q9CZ28 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snf8Q9CZ28 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snf8Q9CZ28 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snf8Q9CZ28 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snf8Q9CZ28 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snf8Q9CZ28 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snf8Q9CZ28 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snf8Q9CZ28 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snf8Q9CZ28 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snf8Q9CZ28 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms