Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY97

Ssu72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssu72Q9CY97 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ssu72Q9CY97 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ssu72Q9CY97 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ssu72Q9CY97 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ssu72Q9CY97 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ssu72Q9CY97 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ssu72Q9CY97 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ssu72Q9CY97 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ssu72Q9CY97 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ssu72Q9CY97 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ssu72Q9CY97 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ssu72Q9CY97 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ssu72Q9CY97 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ssu72Q9CY97 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ssu72Q9CY97 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ssu72Q9CY97 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ssu72Q9CY97 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ssu72Q9CY97 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ssu72Q9CY97 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ssu72Q9CY97 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ssu72Q9CY97 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ssu72Q9CY97 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ssu72Q9CY97 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ssu72Q9CY97 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ssu72Q9CY97 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ssu72Q9CY97 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ssu72Q9CY97 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ssu72Q9CY97 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ssu72Q9CY97 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ssu72Q9CY97 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ssu72Q9CY97 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ssu72Q9CY97 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ssu72Q9CY97 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ssu72Q9CY97 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ssu72Q9CY97 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ssu72Q9CY97 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ssu72Q9CY97 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ssu72Q9CY97 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ssu72Q9CY97 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ssu72Q9CY97 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ssu72Q9CY97 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ssu72Q9CY97 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ssu72Q9CY97 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ssu72Q9CY97 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ssu72Q9CY97 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ssu72Q9CY97 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ssu72Q9CY97 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ssu72Q9CY97 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ssu72Q9CY97 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ssu72Q9CY97 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ssu72Q9CY97 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ssu72Q9CY97 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ssu72Q9CY97 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ssu72Q9CY97 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ssu72Q9CY97 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ssu72Q9CY97 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ssu72Q9CY97 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ssu72Q9CY97 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ssu72Q9CY97 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ssu72Q9CY97 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ssu72Q9CY97 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ssu72Q9CY97 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ssu72Q9CY97 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ssu72Q9CY97 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ssu72Q9CY97 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ssu72Q9CY97 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ssu72Q9CY97 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ssu72Q9CY97 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ssu72Q9CY97 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ssu72Q9CY97 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ssu72Q9CY97 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ssu72Q9CY97 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ssu72Q9CY97 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ssu72Q9CY97 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ssu72Q9CY97 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ssu72Q9CY97 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ssu72Q9CY97 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ssu72Q9CY97 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ssu72Q9CY97 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ssu72Q9CY97 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ssu72Q9CY97 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ssu72Q9CY97 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ssu72Q9CY97 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ssu72Q9CY97 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ssu72Q9CY97 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ssu72Q9CY97 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ssu72Q9CY97 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ssu72Q9CY97 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ssu72Q9CY97 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ssu72Q9CY97 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ssu72Q9CY97 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ssu72Q9CY97 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ssu72Q9CY97 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ssu72Q9CY97 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ssu72Q9CY97 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ssu72Q9CY97 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ssu72Q9CY97 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ssu72Q9CY97 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ssu72Q9CY97 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ssu72Q9CY97 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms