Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV0

Malsu1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Malsu1Q9CWV0 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Malsu1Q9CWV0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Malsu1Q9CWV0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Malsu1Q9CWV0 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Malsu1Q9CWV0 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Malsu1Q9CWV0 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Malsu1Q9CWV0 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Malsu1Q9CWV0 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Malsu1Q9CWV0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Malsu1Q9CWV0 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Malsu1Q9CWV0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Malsu1Q9CWV0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Malsu1Q9CWV0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Malsu1Q9CWV0 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Malsu1Q9CWV0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Malsu1Q9CWV0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Malsu1Q9CWV0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Malsu1Q9CWV0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Malsu1Q9CWV0 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Malsu1Q9CWV0 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Malsu1Q9CWV0 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Malsu1Q9CWV0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Malsu1Q9CWV0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Malsu1Q9CWV0 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Malsu1Q9CWV0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Malsu1Q9CWV0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Malsu1Q9CWV0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Malsu1Q9CWV0 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Malsu1Q9CWV0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Malsu1Q9CWV0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Malsu1Q9CWV0 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Malsu1Q9CWV0 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Malsu1Q9CWV0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Malsu1Q9CWV0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Malsu1Q9CWV0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Malsu1Q9CWV0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Malsu1Q9CWV0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Malsu1Q9CWV0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Malsu1Q9CWV0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Malsu1Q9CWV0 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Malsu1Q9CWV0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Malsu1Q9CWV0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Malsu1Q9CWV0 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Malsu1Q9CWV0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Malsu1Q9CWV0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Malsu1Q9CWV0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Malsu1Q9CWV0 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Malsu1Q9CWV0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Malsu1Q9CWV0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Malsu1Q9CWV0 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Malsu1Q9CWV0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Malsu1Q9CWV0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Malsu1Q9CWV0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Malsu1Q9CWV0 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Malsu1Q9CWV0 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Malsu1Q9CWV0 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Malsu1Q9CWV0 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Malsu1Q9CWV0 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Malsu1Q9CWV0 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Malsu1Q9CWV0 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Malsu1Q9CWV0 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Malsu1Q9CWV0 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Malsu1Q9CWV0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Malsu1Q9CWV0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Malsu1Q9CWV0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Malsu1Q9CWV0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Malsu1Q9CWV0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Malsu1Q9CWV0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Malsu1Q9CWV0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Malsu1Q9CWV0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Malsu1Q9CWV0 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Malsu1Q9CWV0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Malsu1Q9CWV0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Malsu1Q9CWV0 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Malsu1Q9CWV0 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Malsu1Q9CWV0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Malsu1Q9CWV0 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Malsu1Q9CWV0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Malsu1Q9CWV0 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Malsu1Q9CWV0 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Malsu1Q9CWV0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Malsu1Q9CWV0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Malsu1Q9CWV0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Malsu1Q9CWV0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Malsu1Q9CWV0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Malsu1Q9CWV0 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Malsu1Q9CWV0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Malsu1Q9CWV0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Malsu1Q9CWV0 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Malsu1Q9CWV0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Malsu1Q9CWV0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Malsu1Q9CWV0 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Malsu1Q9CWV0 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Malsu1Q9CWV0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Malsu1Q9CWV0 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Malsu1Q9CWV0 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Malsu1Q9CWV0 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Malsu1Q9CWV0 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Malsu1Q9CWV0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Malsu1Q9CWV0 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms