Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN8

Lhfpl3, LHFPL tetraspan subfamily member 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhfpl3Q9CTN8 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lhfpl3Q9CTN8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lhfpl3Q9CTN8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lhfpl3Q9CTN8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lhfpl3Q9CTN8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lhfpl3Q9CTN8 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lhfpl3Q9CTN8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lhfpl3Q9CTN8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lhfpl3Q9CTN8 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lhfpl3Q9CTN8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lhfpl3Q9CTN8 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lhfpl3Q9CTN8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lhfpl3Q9CTN8 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lhfpl3Q9CTN8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Lhfpl3Q9CTN8 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lhfpl3Q9CTN8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lhfpl3Q9CTN8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lhfpl3Q9CTN8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lhfpl3Q9CTN8 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lhfpl3Q9CTN8 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lhfpl3Q9CTN8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Lhfpl3Q9CTN8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lhfpl3Q9CTN8 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lhfpl3Q9CTN8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lhfpl3Q9CTN8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lhfpl3Q9CTN8 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lhfpl3Q9CTN8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lhfpl3Q9CTN8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lhfpl3Q9CTN8 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lhfpl3Q9CTN8 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lhfpl3Q9CTN8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lhfpl3Q9CTN8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lhfpl3Q9CTN8 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Lhfpl3Q9CTN8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lhfpl3Q9CTN8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lhfpl3Q9CTN8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lhfpl3Q9CTN8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lhfpl3Q9CTN8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lhfpl3Q9CTN8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Lhfpl3Q9CTN8 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Lhfpl3Q9CTN8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lhfpl3Q9CTN8 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lhfpl3Q9CTN8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lhfpl3Q9CTN8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lhfpl3Q9CTN8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lhfpl3Q9CTN8 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lhfpl3Q9CTN8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Lhfpl3Q9CTN8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lhfpl3Q9CTN8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lhfpl3Q9CTN8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lhfpl3Q9CTN8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lhfpl3Q9CTN8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lhfpl3Q9CTN8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lhfpl3Q9CTN8 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lhfpl3Q9CTN8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lhfpl3Q9CTN8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lhfpl3Q9CTN8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lhfpl3Q9CTN8 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lhfpl3Q9CTN8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lhfpl3Q9CTN8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lhfpl3Q9CTN8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lhfpl3Q9CTN8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lhfpl3Q9CTN8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lhfpl3Q9CTN8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lhfpl3Q9CTN8 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lhfpl3Q9CTN8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lhfpl3Q9CTN8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lhfpl3Q9CTN8 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lhfpl3Q9CTN8 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lhfpl3Q9CTN8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Lhfpl3Q9CTN8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lhfpl3Q9CTN8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lhfpl3Q9CTN8 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lhfpl3Q9CTN8 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lhfpl3Q9CTN8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lhfpl3Q9CTN8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lhfpl3Q9CTN8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lhfpl3Q9CTN8 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lhfpl3Q9CTN8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lhfpl3Q9CTN8 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lhfpl3Q9CTN8 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lhfpl3Q9CTN8 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lhfpl3Q9CTN8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lhfpl3Q9CTN8 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lhfpl3Q9CTN8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lhfpl3Q9CTN8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lhfpl3Q9CTN8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lhfpl3Q9CTN8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lhfpl3Q9CTN8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lhfpl3Q9CTN8 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lhfpl3Q9CTN8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lhfpl3Q9CTN8 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lhfpl3Q9CTN8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lhfpl3Q9CTN8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lhfpl3Q9CTN8 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lhfpl3Q9CTN8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lhfpl3Q9CTN8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lhfpl3Q9CTN8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lhfpl3Q9CTN8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lhfpl3Q9CTN8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms