Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rprd1bQ9CSU0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rprd1bQ9CSU0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rprd1bQ9CSU0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rprd1bQ9CSU0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rprd1bQ9CSU0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rprd1bQ9CSU0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rprd1bQ9CSU0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rprd1bQ9CSU0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rprd1bQ9CSU0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rprd1bQ9CSU0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rprd1bQ9CSU0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rprd1bQ9CSU0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rprd1bQ9CSU0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Rprd1bQ9CSU0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rprd1bQ9CSU0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rprd1bQ9CSU0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rprd1bQ9CSU0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rprd1bQ9CSU0 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rprd1bQ9CSU0 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rprd1bQ9CSU0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rprd1bQ9CSU0 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rprd1bQ9CSU0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rprd1bQ9CSU0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rprd1bQ9CSU0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rprd1bQ9CSU0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rprd1bQ9CSU0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rprd1bQ9CSU0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rprd1bQ9CSU0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rprd1bQ9CSU0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rprd1bQ9CSU0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rprd1bQ9CSU0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rprd1bQ9CSU0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rprd1bQ9CSU0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rprd1bQ9CSU0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rprd1bQ9CSU0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rprd1bQ9CSU0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rprd1bQ9CSU0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rprd1bQ9CSU0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rprd1bQ9CSU0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rprd1bQ9CSU0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rprd1bQ9CSU0 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rprd1bQ9CSU0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Rprd1bQ9CSU0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rprd1bQ9CSU0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rprd1bQ9CSU0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rprd1bQ9CSU0 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rprd1bQ9CSU0 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rprd1bQ9CSU0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rprd1bQ9CSU0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rprd1bQ9CSU0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rprd1bQ9CSU0 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rprd1bQ9CSU0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rprd1bQ9CSU0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rprd1bQ9CSU0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rprd1bQ9CSU0 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rprd1bQ9CSU0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rprd1bQ9CSU0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rprd1bQ9CSU0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Rprd1bQ9CSU0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rprd1bQ9CSU0 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rprd1bQ9CSU0 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rprd1bQ9CSU0 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rprd1bQ9CSU0 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rprd1bQ9CSU0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rprd1bQ9CSU0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rprd1bQ9CSU0 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rprd1bQ9CSU0 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rprd1bQ9CSU0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Rprd1bQ9CSU0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rprd1bQ9CSU0 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rprd1bQ9CSU0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rprd1bQ9CSU0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rprd1bQ9CSU0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rprd1bQ9CSU0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rprd1bQ9CSU0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rprd1bQ9CSU0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rprd1bQ9CSU0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rprd1bQ9CSU0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Rprd1bQ9CSU0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rprd1bQ9CSU0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Rprd1bQ9CSU0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rprd1bQ9CSU0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rprd1bQ9CSU0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rprd1bQ9CSU0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rprd1bQ9CSU0 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rprd1bQ9CSU0 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rprd1bQ9CSU0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rprd1bQ9CSU0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rprd1bQ9CSU0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Rprd1bQ9CSU0 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rprd1bQ9CSU0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rprd1bQ9CSU0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rprd1bQ9CSU0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rprd1bQ9CSU0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Rprd1bQ9CSU0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rprd1bQ9CSU0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Rprd1bQ9CSU0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rprd1bQ9CSU0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rprd1bQ9CSU0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms