Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQR7

Psenen, Gamma-secretase subunit PEN-2, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PsenenQ9CQR7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PsenenQ9CQR7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PsenenQ9CQR7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PsenenQ9CQR7 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PsenenQ9CQR7 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PsenenQ9CQR7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PsenenQ9CQR7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PsenenQ9CQR7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PsenenQ9CQR7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PsenenQ9CQR7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PsenenQ9CQR7 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PsenenQ9CQR7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PsenenQ9CQR7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PsenenQ9CQR7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PsenenQ9CQR7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PsenenQ9CQR7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PsenenQ9CQR7 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PsenenQ9CQR7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PsenenQ9CQR7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PsenenQ9CQR7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PsenenQ9CQR7 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PsenenQ9CQR7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PsenenQ9CQR7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PsenenQ9CQR7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PsenenQ9CQR7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PsenenQ9CQR7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PsenenQ9CQR7 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PsenenQ9CQR7 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PsenenQ9CQR7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PsenenQ9CQR7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PsenenQ9CQR7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PsenenQ9CQR7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PsenenQ9CQR7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PsenenQ9CQR7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PsenenQ9CQR7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PsenenQ9CQR7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PsenenQ9CQR7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PsenenQ9CQR7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PsenenQ9CQR7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PsenenQ9CQR7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PsenenQ9CQR7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PsenenQ9CQR7 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PsenenQ9CQR7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PsenenQ9CQR7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PsenenQ9CQR7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PsenenQ9CQR7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PsenenQ9CQR7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PsenenQ9CQR7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PsenenQ9CQR7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PsenenQ9CQR7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PsenenQ9CQR7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PsenenQ9CQR7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PsenenQ9CQR7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PsenenQ9CQR7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PsenenQ9CQR7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PsenenQ9CQR7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PsenenQ9CQR7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PsenenQ9CQR7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PsenenQ9CQR7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PsenenQ9CQR7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PsenenQ9CQR7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PsenenQ9CQR7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PsenenQ9CQR7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PsenenQ9CQR7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PsenenQ9CQR7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PsenenQ9CQR7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PsenenQ9CQR7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PsenenQ9CQR7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PsenenQ9CQR7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PsenenQ9CQR7 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PsenenQ9CQR7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PsenenQ9CQR7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PsenenQ9CQR7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PsenenQ9CQR7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PsenenQ9CQR7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PsenenQ9CQR7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PsenenQ9CQR7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PsenenQ9CQR7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PsenenQ9CQR7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PsenenQ9CQR7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PsenenQ9CQR7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PsenenQ9CQR7 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PsenenQ9CQR7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PsenenQ9CQR7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PsenenQ9CQR7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PsenenQ9CQR7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PsenenQ9CQR7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PsenenQ9CQR7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PsenenQ9CQR7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PsenenQ9CQR7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PsenenQ9CQR7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PsenenQ9CQR7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PsenenQ9CQR7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PsenenQ9CQR7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PsenenQ9CQR7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PsenenQ9CQR7 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PsenenQ9CQR7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PsenenQ9CQR7 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PsenenQ9CQR7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PsenenQ9CQR7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms