Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQI9

Med30, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 30, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med30Q9CQI9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Med30Q9CQI9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Med30Q9CQI9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Med30Q9CQI9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Med30Q9CQI9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Med30Q9CQI9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Med30Q9CQI9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Med30Q9CQI9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Med30Q9CQI9 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Med30Q9CQI9 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Med30Q9CQI9 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Med30Q9CQI9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Med30Q9CQI9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Med30Q9CQI9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Med30Q9CQI9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Med30Q9CQI9 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Med30Q9CQI9 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Med30Q9CQI9 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Med30Q9CQI9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Med30Q9CQI9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Med30Q9CQI9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Med30Q9CQI9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Med30Q9CQI9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Med30Q9CQI9 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Med30Q9CQI9 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Med30Q9CQI9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Med30Q9CQI9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Med30Q9CQI9 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Med30Q9CQI9 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Med30Q9CQI9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Med30Q9CQI9 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Med30Q9CQI9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Med30Q9CQI9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Med30Q9CQI9 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Med30Q9CQI9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Med30Q9CQI9 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Med30Q9CQI9 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Med30Q9CQI9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Med30Q9CQI9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Med30Q9CQI9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Med30Q9CQI9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Med30Q9CQI9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Med30Q9CQI9 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Med30Q9CQI9 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Med30Q9CQI9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Med30Q9CQI9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Med30Q9CQI9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Med30Q9CQI9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Med30Q9CQI9 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Med30Q9CQI9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Med30Q9CQI9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Med30Q9CQI9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Med30Q9CQI9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Med30Q9CQI9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Med30Q9CQI9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Med30Q9CQI9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Med30Q9CQI9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Med30Q9CQI9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Med30Q9CQI9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Med30Q9CQI9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Med30Q9CQI9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Med30Q9CQI9 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Med30Q9CQI9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Med30Q9CQI9 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Med30Q9CQI9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Med30Q9CQI9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Med30Q9CQI9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Med30Q9CQI9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Med30Q9CQI9 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Med30Q9CQI9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Med30Q9CQI9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Med30Q9CQI9 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Med30Q9CQI9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Med30Q9CQI9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Med30Q9CQI9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Med30Q9CQI9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Med30Q9CQI9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Med30Q9CQI9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Med30Q9CQI9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Med30Q9CQI9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Med30Q9CQI9 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Med30Q9CQI9 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Med30Q9CQI9 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Med30Q9CQI9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Med30Q9CQI9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Med30Q9CQI9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Med30Q9CQI9 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Med30Q9CQI9 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Med30Q9CQI9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Med30Q9CQI9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Med30Q9CQI9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Med30Q9CQI9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Med30Q9CQI9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Med30Q9CQI9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Med30Q9CQI9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Med30Q9CQI9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Med30Q9CQI9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Med30Q9CQI9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Med30Q9CQI9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Med30Q9CQI9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms