Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE8

RTRAF, RNA transcription, translation and transport factor protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTRAFQ9CQE8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RTRAFQ9CQE8 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
RTRAFQ9CQE8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RTRAFQ9CQE8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RTRAFQ9CQE8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RTRAFQ9CQE8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RTRAFQ9CQE8 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RTRAFQ9CQE8 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RTRAFQ9CQE8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RTRAFQ9CQE8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RTRAFQ9CQE8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RTRAFQ9CQE8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RTRAFQ9CQE8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RTRAFQ9CQE8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RTRAFQ9CQE8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RTRAFQ9CQE8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RTRAFQ9CQE8 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RTRAFQ9CQE8 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RTRAFQ9CQE8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RTRAFQ9CQE8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RTRAFQ9CQE8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RTRAFQ9CQE8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RTRAFQ9CQE8 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RTRAFQ9CQE8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RTRAFQ9CQE8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RTRAFQ9CQE8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RTRAFQ9CQE8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RTRAFQ9CQE8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RTRAFQ9CQE8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RTRAFQ9CQE8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RTRAFQ9CQE8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RTRAFQ9CQE8 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RTRAFQ9CQE8 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RTRAFQ9CQE8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RTRAFQ9CQE8 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RTRAFQ9CQE8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RTRAFQ9CQE8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RTRAFQ9CQE8 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RTRAFQ9CQE8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RTRAFQ9CQE8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
RTRAFQ9CQE8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
RTRAFQ9CQE8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RTRAFQ9CQE8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
RTRAFQ9CQE8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RTRAFQ9CQE8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RTRAFQ9CQE8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RTRAFQ9CQE8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RTRAFQ9CQE8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RTRAFQ9CQE8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RTRAFQ9CQE8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RTRAFQ9CQE8 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RTRAFQ9CQE8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RTRAFQ9CQE8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RTRAFQ9CQE8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RTRAFQ9CQE8 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
RTRAFQ9CQE8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RTRAFQ9CQE8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RTRAFQ9CQE8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RTRAFQ9CQE8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
RTRAFQ9CQE8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RTRAFQ9CQE8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RTRAFQ9CQE8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RTRAFQ9CQE8 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RTRAFQ9CQE8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RTRAFQ9CQE8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RTRAFQ9CQE8 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RTRAFQ9CQE8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RTRAFQ9CQE8 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RTRAFQ9CQE8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RTRAFQ9CQE8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RTRAFQ9CQE8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RTRAFQ9CQE8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RTRAFQ9CQE8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RTRAFQ9CQE8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RTRAFQ9CQE8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RTRAFQ9CQE8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RTRAFQ9CQE8 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RTRAFQ9CQE8 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RTRAFQ9CQE8 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RTRAFQ9CQE8 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RTRAFQ9CQE8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RTRAFQ9CQE8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RTRAFQ9CQE8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RTRAFQ9CQE8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RTRAFQ9CQE8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RTRAFQ9CQE8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RTRAFQ9CQE8 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RTRAFQ9CQE8 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RTRAFQ9CQE8 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RTRAFQ9CQE8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RTRAFQ9CQE8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RTRAFQ9CQE8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RTRAFQ9CQE8 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RTRAFQ9CQE8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RTRAFQ9CQE8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RTRAFQ9CQE8 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RTRAFQ9CQE8 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RTRAFQ9CQE8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RTRAFQ9CQE8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RTRAFQ9CQE8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms