Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD4

Chmp1b2, Charged multivesicular body protein 1b-2, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp1b2Q9CQD4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Chmp1b2Q9CQD4 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Chmp1b2Q9CQD4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Chmp1b2Q9CQD4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Chmp1b2Q9CQD4 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Chmp1b2Q9CQD4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Chmp1b2Q9CQD4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Chmp1b2Q9CQD4 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Chmp1b2Q9CQD4 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Chmp1b2Q9CQD4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Chmp1b2Q9CQD4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Chmp1b2Q9CQD4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Chmp1b2Q9CQD4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Chmp1b2Q9CQD4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Chmp1b2Q9CQD4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Chmp1b2Q9CQD4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Chmp1b2Q9CQD4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Chmp1b2Q9CQD4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Chmp1b2Q9CQD4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Chmp1b2Q9CQD4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Chmp1b2Q9CQD4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Chmp1b2Q9CQD4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Chmp1b2Q9CQD4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Chmp1b2Q9CQD4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Chmp1b2Q9CQD4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Chmp1b2Q9CQD4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Chmp1b2Q9CQD4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Chmp1b2Q9CQD4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Chmp1b2Q9CQD4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Chmp1b2Q9CQD4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Chmp1b2Q9CQD4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Chmp1b2Q9CQD4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Chmp1b2Q9CQD4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Chmp1b2Q9CQD4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Chmp1b2Q9CQD4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Chmp1b2Q9CQD4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Chmp1b2Q9CQD4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Chmp1b2Q9CQD4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Chmp1b2Q9CQD4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Chmp1b2Q9CQD4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Chmp1b2Q9CQD4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Chmp1b2Q9CQD4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Chmp1b2Q9CQD4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Chmp1b2Q9CQD4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Chmp1b2Q9CQD4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Chmp1b2Q9CQD4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Chmp1b2Q9CQD4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Chmp1b2Q9CQD4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Chmp1b2Q9CQD4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Chmp1b2Q9CQD4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Chmp1b2Q9CQD4 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Chmp1b2Q9CQD4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Chmp1b2Q9CQD4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Chmp1b2Q9CQD4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Chmp1b2Q9CQD4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Chmp1b2Q9CQD4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Chmp1b2Q9CQD4 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Chmp1b2Q9CQD4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Chmp1b2Q9CQD4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Chmp1b2Q9CQD4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Chmp1b2Q9CQD4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Chmp1b2Q9CQD4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Chmp1b2Q9CQD4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Chmp1b2Q9CQD4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Chmp1b2Q9CQD4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Chmp1b2Q9CQD4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Chmp1b2Q9CQD4 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Chmp1b2Q9CQD4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Chmp1b2Q9CQD4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Chmp1b2Q9CQD4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Chmp1b2Q9CQD4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Chmp1b2Q9CQD4 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Chmp1b2Q9CQD4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Chmp1b2Q9CQD4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Chmp1b2Q9CQD4 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Chmp1b2Q9CQD4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Chmp1b2Q9CQD4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Chmp1b2Q9CQD4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Chmp1b2Q9CQD4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Chmp1b2Q9CQD4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Chmp1b2Q9CQD4 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Chmp1b2Q9CQD4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Chmp1b2Q9CQD4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Chmp1b2Q9CQD4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Chmp1b2Q9CQD4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Chmp1b2Q9CQD4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Chmp1b2Q9CQD4 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Chmp1b2Q9CQD4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Chmp1b2Q9CQD4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Chmp1b2Q9CQD4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Chmp1b2Q9CQD4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Chmp1b2Q9CQD4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Chmp1b2Q9CQD4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Chmp1b2Q9CQD4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Chmp1b2Q9CQD4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Chmp1b2Q9CQD4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Chmp1b2Q9CQD4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Chmp1b2Q9CQD4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Chmp1b2Q9CQD4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Chmp1b2Q9CQD4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms