Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Chmp3Q9CQ10 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Chmp3Q9CQ10 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Chmp3Q9CQ10 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Chmp3Q9CQ10 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Chmp3Q9CQ10 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Chmp3Q9CQ10 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Chmp3Q9CQ10 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Chmp3Q9CQ10 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Chmp3Q9CQ10 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Chmp3Q9CQ10 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Chmp3Q9CQ10 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Chmp3Q9CQ10 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Chmp3Q9CQ10 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Chmp3Q9CQ10 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Chmp3Q9CQ10 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Chmp3Q9CQ10 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Chmp3Q9CQ10 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Chmp3Q9CQ10 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Chmp3Q9CQ10 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Chmp3Q9CQ10 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Chmp3Q9CQ10 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Chmp3Q9CQ10 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Chmp3Q9CQ10 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Chmp3Q9CQ10 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Chmp3Q9CQ10 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Chmp3Q9CQ10 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Chmp3Q9CQ10 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Chmp3Q9CQ10 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Chmp3Q9CQ10 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Chmp3Q9CQ10 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Chmp3Q9CQ10 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Chmp3Q9CQ10 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Chmp3Q9CQ10 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Chmp3Q9CQ10 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Chmp3Q9CQ10 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Chmp3Q9CQ10 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Chmp3Q9CQ10 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Chmp3Q9CQ10 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Chmp3Q9CQ10 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Chmp3Q9CQ10 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Chmp3Q9CQ10 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Chmp3Q9CQ10 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Chmp3Q9CQ10 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Chmp3Q9CQ10 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Chmp3Q9CQ10 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Chmp3Q9CQ10 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Chmp3Q9CQ10 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Chmp3Q9CQ10 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Chmp3Q9CQ10 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Chmp3Q9CQ10 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Chmp3Q9CQ10 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Chmp3Q9CQ10 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Chmp3Q9CQ10 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Chmp3Q9CQ10 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Chmp3Q9CQ10 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Chmp3Q9CQ10 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Chmp3Q9CQ10 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Chmp3Q9CQ10 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Chmp3Q9CQ10 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Chmp3Q9CQ10 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Chmp3Q9CQ10 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Chmp3Q9CQ10 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Chmp3Q9CQ10 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Chmp3Q9CQ10 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Chmp3Q9CQ10 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Chmp3Q9CQ10 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Chmp3Q9CQ10 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Chmp3Q9CQ10 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Chmp3Q9CQ10 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Chmp3Q9CQ10 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Chmp3Q9CQ10 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Chmp3Q9CQ10 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Chmp3Q9CQ10 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.51■■□□□ 1.84
Chmp3Q9CQ10 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Chmp3Q9CQ10 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Chmp3Q9CQ10 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Chmp3Q9CQ10 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Chmp3Q9CQ10 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Chmp3Q9CQ10 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Chmp3Q9CQ10 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Chmp3Q9CQ10 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Chmp3Q9CQ10 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Chmp3Q9CQ10 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Chmp3Q9CQ10 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Chmp3Q9CQ10 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Chmp3Q9CQ10 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Chmp3Q9CQ10 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Chmp3Q9CQ10 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Chmp3Q9CQ10 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Chmp3Q9CQ10 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Chmp3Q9CQ10 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Chmp3Q9CQ10 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Chmp3Q9CQ10 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Chmp3Q9CQ10 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Chmp3Q9CQ10 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Chmp3Q9CQ10 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Chmp3Q9CQ10 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Chmp3Q9CQ10 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Chmp3Q9CQ10 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
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