Protein–RNA interactions for Protein: Q91X60

Chrna2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna2Q91X60 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Chrna2Q91X60 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Chrna2Q91X60 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Chrna2Q91X60 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Chrna2Q91X60 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Chrna2Q91X60 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Chrna2Q91X60 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Chrna2Q91X60 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Chrna2Q91X60 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Chrna2Q91X60 Gm20865-201ENSMUST00000179095 856 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Chrna2Q91X60 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Chrna2Q91X60 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Chrna2Q91X60 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Chrna2Q91X60 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Chrna2Q91X60 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Chrna2Q91X60 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Chrna2Q91X60 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Chrna2Q91X60 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Chrna2Q91X60 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Chrna2Q91X60 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Chrna2Q91X60 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Chrna2Q91X60 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Chrna2Q91X60 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Chrna2Q91X60 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Chrna2Q91X60 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Chrna2Q91X60 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Chrna2Q91X60 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Chrna2Q91X60 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Chrna2Q91X60 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Chrna2Q91X60 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
Chrna2Q91X60 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Chrna2Q91X60 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Chrna2Q91X60 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Chrna2Q91X60 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Chrna2Q91X60 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Chrna2Q91X60 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Chrna2Q91X60 Clec4d-201ENSMUST00000032240 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Chrna2Q91X60 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Chrna2Q91X60 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Chrna2Q91X60 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Chrna2Q91X60 Gm21156-201ENSMUST00000189693 869 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Chrna2Q91X60 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Chrna2Q91X60 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Chrna2Q91X60 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Chrna2Q91X60 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Chrna2Q91X60 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Chrna2Q91X60 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Chrna2Q91X60 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Chrna2Q91X60 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Chrna2Q91X60 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Chrna2Q91X60 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Chrna2Q91X60 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Chrna2Q91X60 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Chrna2Q91X60 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Chrna2Q91X60 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Chrna2Q91X60 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Chrna2Q91X60 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Chrna2Q91X60 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Chrna2Q91X60 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Chrna2Q91X60 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Chrna2Q91X60 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Chrna2Q91X60 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Chrna2Q91X60 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Chrna2Q91X60 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Chrna2Q91X60 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Chrna2Q91X60 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Chrna2Q91X60 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Chrna2Q91X60 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Chrna2Q91X60 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Chrna2Q91X60 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Chrna2Q91X60 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Chrna2Q91X60 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Chrna2Q91X60 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Chrna2Q91X60 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Chrna2Q91X60 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Chrna2Q91X60 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Chrna2Q91X60 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Chrna2Q91X60 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Chrna2Q91X60 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Chrna2Q91X60 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Chrna2Q91X60 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Chrna2Q91X60 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Chrna2Q91X60 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Chrna2Q91X60 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Chrna2Q91X60 Gm11361-201ENSMUST00000223428 607 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Chrna2Q91X60 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Chrna2Q91X60 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Chrna2Q91X60 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Chrna2Q91X60 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Chrna2Q91X60 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Chrna2Q91X60 AC154634.3-201ENSMUST00000224589 736 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Chrna2Q91X60 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Chrna2Q91X60 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Chrna2Q91X60 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Chrna2Q91X60 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Chrna2Q91X60 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Chrna2Q91X60 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Chrna2Q91X60 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Chrna2Q91X60 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Chrna2Q91X60 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms