Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCD7

Kdm4c, Lysine-specific demethylase 4C, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4cQ8VCD7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Kdm4cQ8VCD7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Kdm4cQ8VCD7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Kdm4cQ8VCD7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Kdm4cQ8VCD7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Kdm4cQ8VCD7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Kdm4cQ8VCD7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Kdm4cQ8VCD7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Kdm4cQ8VCD7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Kdm4cQ8VCD7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Kdm4cQ8VCD7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Kdm4cQ8VCD7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Kdm4cQ8VCD7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Kdm4cQ8VCD7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Kdm4cQ8VCD7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Kdm4cQ8VCD7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Kdm4cQ8VCD7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Kdm4cQ8VCD7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Kdm4cQ8VCD7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Kdm4cQ8VCD7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Kdm4cQ8VCD7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Kdm4cQ8VCD7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Kdm4cQ8VCD7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Kdm4cQ8VCD7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Kdm4cQ8VCD7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Kdm4cQ8VCD7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Kdm4cQ8VCD7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Kdm4cQ8VCD7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Kdm4cQ8VCD7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Kdm4cQ8VCD7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Kdm4cQ8VCD7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Kdm4cQ8VCD7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Kdm4cQ8VCD7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Kdm4cQ8VCD7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Kdm4cQ8VCD7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Kdm4cQ8VCD7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Kdm4cQ8VCD7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Kdm4cQ8VCD7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Kdm4cQ8VCD7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Kdm4cQ8VCD7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Kdm4cQ8VCD7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Kdm4cQ8VCD7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Kdm4cQ8VCD7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Kdm4cQ8VCD7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Kdm4cQ8VCD7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Kdm4cQ8VCD7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Kdm4cQ8VCD7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Kdm4cQ8VCD7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Kdm4cQ8VCD7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Kdm4cQ8VCD7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Kdm4cQ8VCD7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Kdm4cQ8VCD7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Kdm4cQ8VCD7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Kdm4cQ8VCD7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Kdm4cQ8VCD7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Kdm4cQ8VCD7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Kdm4cQ8VCD7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Kdm4cQ8VCD7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Kdm4cQ8VCD7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Kdm4cQ8VCD7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Kdm4cQ8VCD7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Kdm4cQ8VCD7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Kdm4cQ8VCD7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Kdm4cQ8VCD7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Kdm4cQ8VCD7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Kdm4cQ8VCD7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Kdm4cQ8VCD7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Kdm4cQ8VCD7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Kdm4cQ8VCD7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Kdm4cQ8VCD7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Kdm4cQ8VCD7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Kdm4cQ8VCD7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Kdm4cQ8VCD7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Kdm4cQ8VCD7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Kdm4cQ8VCD7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Kdm4cQ8VCD7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Kdm4cQ8VCD7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Kdm4cQ8VCD7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Kdm4cQ8VCD7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Kdm4cQ8VCD7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Kdm4cQ8VCD7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Kdm4cQ8VCD7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Kdm4cQ8VCD7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Kdm4cQ8VCD7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Kdm4cQ8VCD7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Kdm4cQ8VCD7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Kdm4cQ8VCD7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Kdm4cQ8VCD7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Kdm4cQ8VCD7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Kdm4cQ8VCD7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Kdm4cQ8VCD7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Kdm4cQ8VCD7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Kdm4cQ8VCD7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Kdm4cQ8VCD7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Kdm4cQ8VCD7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Kdm4cQ8VCD7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Kdm4cQ8VCD7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Kdm4cQ8VCD7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Kdm4cQ8VCD7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Kdm4cQ8VCD7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms