Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3B7

Brd8, Bromodomain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd8Q8R3B7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Brd8Q8R3B7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Brd8Q8R3B7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Brd8Q8R3B7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Brd8Q8R3B7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Brd8Q8R3B7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Brd8Q8R3B7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Brd8Q8R3B7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Brd8Q8R3B7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Brd8Q8R3B7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Brd8Q8R3B7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Brd8Q8R3B7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Brd8Q8R3B7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Brd8Q8R3B7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Brd8Q8R3B7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Brd8Q8R3B7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Brd8Q8R3B7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Brd8Q8R3B7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Brd8Q8R3B7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Brd8Q8R3B7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Brd8Q8R3B7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Brd8Q8R3B7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Brd8Q8R3B7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Brd8Q8R3B7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Brd8Q8R3B7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Brd8Q8R3B7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Brd8Q8R3B7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Brd8Q8R3B7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Brd8Q8R3B7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Brd8Q8R3B7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Brd8Q8R3B7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Brd8Q8R3B7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Brd8Q8R3B7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Brd8Q8R3B7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Brd8Q8R3B7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Brd8Q8R3B7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Brd8Q8R3B7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Brd8Q8R3B7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Brd8Q8R3B7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Brd8Q8R3B7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Brd8Q8R3B7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Brd8Q8R3B7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Brd8Q8R3B7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Brd8Q8R3B7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Brd8Q8R3B7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Brd8Q8R3B7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Brd8Q8R3B7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Brd8Q8R3B7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Brd8Q8R3B7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Brd8Q8R3B7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Brd8Q8R3B7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Brd8Q8R3B7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Brd8Q8R3B7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Brd8Q8R3B7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Brd8Q8R3B7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Brd8Q8R3B7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Brd8Q8R3B7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Brd8Q8R3B7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Brd8Q8R3B7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Brd8Q8R3B7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Brd8Q8R3B7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Brd8Q8R3B7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Brd8Q8R3B7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Brd8Q8R3B7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Brd8Q8R3B7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Brd8Q8R3B7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Brd8Q8R3B7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Brd8Q8R3B7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Brd8Q8R3B7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Brd8Q8R3B7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Brd8Q8R3B7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Brd8Q8R3B7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Brd8Q8R3B7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Brd8Q8R3B7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Brd8Q8R3B7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Brd8Q8R3B7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Brd8Q8R3B7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Brd8Q8R3B7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Brd8Q8R3B7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Brd8Q8R3B7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Brd8Q8R3B7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Brd8Q8R3B7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Brd8Q8R3B7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Brd8Q8R3B7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Brd8Q8R3B7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Brd8Q8R3B7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Brd8Q8R3B7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Brd8Q8R3B7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Brd8Q8R3B7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Brd8Q8R3B7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Brd8Q8R3B7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Brd8Q8R3B7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Brd8Q8R3B7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Brd8Q8R3B7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Brd8Q8R3B7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Brd8Q8R3B7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Brd8Q8R3B7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Brd8Q8R3B7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Brd8Q8R3B7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Brd8Q8R3B7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125.8 ms