Protein–RNA interactions for Protein: Q8R361

Rab11fip5, Rab11 family-interacting protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip5Q8R361 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab11fip5Q8R361 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab11fip5Q8R361 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab11fip5Q8R361 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab11fip5Q8R361 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab11fip5Q8R361 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab11fip5Q8R361 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab11fip5Q8R361 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab11fip5Q8R361 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab11fip5Q8R361 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab11fip5Q8R361 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rab11fip5Q8R361 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rab11fip5Q8R361 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rab11fip5Q8R361 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rab11fip5Q8R361 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Rab11fip5Q8R361 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rab11fip5Q8R361 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rab11fip5Q8R361 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rab11fip5Q8R361 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rab11fip5Q8R361 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rab11fip5Q8R361 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Rab11fip5Q8R361 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Rab11fip5Q8R361 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Rab11fip5Q8R361 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab11fip5Q8R361 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab11fip5Q8R361 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab11fip5Q8R361 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab11fip5Q8R361 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab11fip5Q8R361 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab11fip5Q8R361 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab11fip5Q8R361 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab11fip5Q8R361 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab11fip5Q8R361 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab11fip5Q8R361 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab11fip5Q8R361 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab11fip5Q8R361 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab11fip5Q8R361 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab11fip5Q8R361 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab11fip5Q8R361 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab11fip5Q8R361 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab11fip5Q8R361 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab11fip5Q8R361 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab11fip5Q8R361 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab11fip5Q8R361 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab11fip5Q8R361 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab11fip5Q8R361 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab11fip5Q8R361 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab11fip5Q8R361 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab11fip5Q8R361 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab11fip5Q8R361 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab11fip5Q8R361 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab11fip5Q8R361 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab11fip5Q8R361 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab11fip5Q8R361 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab11fip5Q8R361 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab11fip5Q8R361 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab11fip5Q8R361 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab11fip5Q8R361 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab11fip5Q8R361 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab11fip5Q8R361 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab11fip5Q8R361 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab11fip5Q8R361 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab11fip5Q8R361 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab11fip5Q8R361 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab11fip5Q8R361 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab11fip5Q8R361 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab11fip5Q8R361 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rab11fip5Q8R361 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rab11fip5Q8R361 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab11fip5Q8R361 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab11fip5Q8R361 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab11fip5Q8R361 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab11fip5Q8R361 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab11fip5Q8R361 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab11fip5Q8R361 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab11fip5Q8R361 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab11fip5Q8R361 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab11fip5Q8R361 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab11fip5Q8R361 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab11fip5Q8R361 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab11fip5Q8R361 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab11fip5Q8R361 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab11fip5Q8R361 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab11fip5Q8R361 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab11fip5Q8R361 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab11fip5Q8R361 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab11fip5Q8R361 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab11fip5Q8R361 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab11fip5Q8R361 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab11fip5Q8R361 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab11fip5Q8R361 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab11fip5Q8R361 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab11fip5Q8R361 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab11fip5Q8R361 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab11fip5Q8R361 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab11fip5Q8R361 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab11fip5Q8R361 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab11fip5Q8R361 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab11fip5Q8R361 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab11fip5Q8R361 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms