Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2P1

Klhl25, Kelch-like protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl25Q8R2P1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klhl25Q8R2P1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klhl25Q8R2P1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Klhl25Q8R2P1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Klhl25Q8R2P1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Klhl25Q8R2P1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Klhl25Q8R2P1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Klhl25Q8R2P1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Klhl25Q8R2P1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Klhl25Q8R2P1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl25Q8R2P1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl25Q8R2P1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl25Q8R2P1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl25Q8R2P1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl25Q8R2P1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl25Q8R2P1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl25Q8R2P1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl25Q8R2P1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl25Q8R2P1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl25Q8R2P1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl25Q8R2P1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl25Q8R2P1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klhl25Q8R2P1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klhl25Q8R2P1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klhl25Q8R2P1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klhl25Q8R2P1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klhl25Q8R2P1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klhl25Q8R2P1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klhl25Q8R2P1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klhl25Q8R2P1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klhl25Q8R2P1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klhl25Q8R2P1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klhl25Q8R2P1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klhl25Q8R2P1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klhl25Q8R2P1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klhl25Q8R2P1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klhl25Q8R2P1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klhl25Q8R2P1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klhl25Q8R2P1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klhl25Q8R2P1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klhl25Q8R2P1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klhl25Q8R2P1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klhl25Q8R2P1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klhl25Q8R2P1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Klhl25Q8R2P1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Klhl25Q8R2P1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klhl25Q8R2P1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klhl25Q8R2P1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klhl25Q8R2P1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klhl25Q8R2P1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klhl25Q8R2P1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klhl25Q8R2P1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klhl25Q8R2P1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klhl25Q8R2P1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klhl25Q8R2P1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klhl25Q8R2P1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klhl25Q8R2P1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klhl25Q8R2P1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klhl25Q8R2P1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klhl25Q8R2P1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klhl25Q8R2P1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klhl25Q8R2P1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klhl25Q8R2P1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klhl25Q8R2P1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klhl25Q8R2P1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klhl25Q8R2P1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klhl25Q8R2P1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Klhl25Q8R2P1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klhl25Q8R2P1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klhl25Q8R2P1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klhl25Q8R2P1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klhl25Q8R2P1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klhl25Q8R2P1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klhl25Q8R2P1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klhl25Q8R2P1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klhl25Q8R2P1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klhl25Q8R2P1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klhl25Q8R2P1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klhl25Q8R2P1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Klhl25Q8R2P1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klhl25Q8R2P1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klhl25Q8R2P1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klhl25Q8R2P1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klhl25Q8R2P1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klhl25Q8R2P1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klhl25Q8R2P1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klhl25Q8R2P1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klhl25Q8R2P1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klhl25Q8R2P1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klhl25Q8R2P1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klhl25Q8R2P1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klhl25Q8R2P1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klhl25Q8R2P1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klhl25Q8R2P1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klhl25Q8R2P1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klhl25Q8R2P1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klhl25Q8R2P1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Klhl25Q8R2P1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klhl25Q8R2P1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klhl25Q8R2P1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms