Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

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Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Abcf3Q8K268 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Abcf3Q8K268 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Abcf3Q8K268 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Abcf3Q8K268 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Abcf3Q8K268 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Abcf3Q8K268 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Abcf3Q8K268 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Abcf3Q8K268 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Abcf3Q8K268 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Abcf3Q8K268 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Abcf3Q8K268 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Abcf3Q8K268 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Abcf3Q8K268 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Abcf3Q8K268 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Abcf3Q8K268 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Abcf3Q8K268 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Abcf3Q8K268 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Abcf3Q8K268 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Abcf3Q8K268 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Abcf3Q8K268 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Abcf3Q8K268 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Abcf3Q8K268 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Abcf3Q8K268 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Abcf3Q8K268 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Abcf3Q8K268 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Abcf3Q8K268 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Abcf3Q8K268 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Abcf3Q8K268 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Abcf3Q8K268 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Abcf3Q8K268 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Abcf3Q8K268 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Abcf3Q8K268 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Abcf3Q8K268 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Abcf3Q8K268 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Abcf3Q8K268 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Abcf3Q8K268 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Abcf3Q8K268 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Abcf3Q8K268 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Abcf3Q8K268 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Abcf3Q8K268 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Abcf3Q8K268 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Abcf3Q8K268 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Abcf3Q8K268 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Abcf3Q8K268 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Abcf3Q8K268 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Abcf3Q8K268 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Abcf3Q8K268 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Abcf3Q8K268 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Abcf3Q8K268 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Abcf3Q8K268 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Abcf3Q8K268 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Abcf3Q8K268 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Abcf3Q8K268 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Abcf3Q8K268 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Abcf3Q8K268 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Abcf3Q8K268 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Abcf3Q8K268 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Abcf3Q8K268 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Abcf3Q8K268 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Abcf3Q8K268 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Abcf3Q8K268 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Abcf3Q8K268 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Abcf3Q8K268 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Abcf3Q8K268 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Abcf3Q8K268 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Abcf3Q8K268 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Abcf3Q8K268 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Abcf3Q8K268 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Abcf3Q8K268 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Abcf3Q8K268 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Abcf3Q8K268 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Abcf3Q8K268 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Abcf3Q8K268 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Abcf3Q8K268 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Abcf3Q8K268 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Abcf3Q8K268 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Abcf3Q8K268 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Abcf3Q8K268 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Abcf3Q8K268 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Abcf3Q8K268 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Abcf3Q8K268 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Abcf3Q8K268 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Abcf3Q8K268 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Abcf3Q8K268 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Abcf3Q8K268 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Abcf3Q8K268 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Abcf3Q8K268 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Abcf3Q8K268 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Abcf3Q8K268 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Abcf3Q8K268 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Abcf3Q8K268 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Abcf3Q8K268 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Abcf3Q8K268 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Abcf3Q8K268 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Abcf3Q8K268 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Abcf3Q8K268 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Abcf3Q8K268 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Abcf3Q8K268 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Abcf3Q8K268 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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