Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGM2

Rp1l1, Retinitis pigmentosa 1-like 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rp1l1Q8CGM2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rp1l1Q8CGM2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rp1l1Q8CGM2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Rp1l1Q8CGM2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rp1l1Q8CGM2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Rp1l1Q8CGM2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rp1l1Q8CGM2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rp1l1Q8CGM2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rp1l1Q8CGM2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rp1l1Q8CGM2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rp1l1Q8CGM2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rp1l1Q8CGM2 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rp1l1Q8CGM2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rp1l1Q8CGM2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rp1l1Q8CGM2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rp1l1Q8CGM2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rp1l1Q8CGM2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rp1l1Q8CGM2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rp1l1Q8CGM2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rp1l1Q8CGM2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rp1l1Q8CGM2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rp1l1Q8CGM2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rp1l1Q8CGM2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rp1l1Q8CGM2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rp1l1Q8CGM2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rp1l1Q8CGM2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rp1l1Q8CGM2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rp1l1Q8CGM2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rp1l1Q8CGM2 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rp1l1Q8CGM2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rp1l1Q8CGM2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rp1l1Q8CGM2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rp1l1Q8CGM2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rp1l1Q8CGM2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rp1l1Q8CGM2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rp1l1Q8CGM2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rp1l1Q8CGM2 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rp1l1Q8CGM2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rp1l1Q8CGM2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rp1l1Q8CGM2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rp1l1Q8CGM2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rp1l1Q8CGM2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rp1l1Q8CGM2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Rp1l1Q8CGM2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rp1l1Q8CGM2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rp1l1Q8CGM2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rp1l1Q8CGM2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rp1l1Q8CGM2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rp1l1Q8CGM2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rp1l1Q8CGM2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Rp1l1Q8CGM2 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rp1l1Q8CGM2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rp1l1Q8CGM2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rp1l1Q8CGM2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rp1l1Q8CGM2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rp1l1Q8CGM2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rp1l1Q8CGM2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rp1l1Q8CGM2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rp1l1Q8CGM2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rp1l1Q8CGM2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Rp1l1Q8CGM2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rp1l1Q8CGM2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Rp1l1Q8CGM2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rp1l1Q8CGM2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rp1l1Q8CGM2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rp1l1Q8CGM2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rp1l1Q8CGM2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rp1l1Q8CGM2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rp1l1Q8CGM2 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rp1l1Q8CGM2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rp1l1Q8CGM2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rp1l1Q8CGM2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rp1l1Q8CGM2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rp1l1Q8CGM2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rp1l1Q8CGM2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rp1l1Q8CGM2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rp1l1Q8CGM2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rp1l1Q8CGM2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rp1l1Q8CGM2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Rp1l1Q8CGM2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rp1l1Q8CGM2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rp1l1Q8CGM2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rp1l1Q8CGM2 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rp1l1Q8CGM2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rp1l1Q8CGM2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rp1l1Q8CGM2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rp1l1Q8CGM2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rp1l1Q8CGM2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rp1l1Q8CGM2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rp1l1Q8CGM2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rp1l1Q8CGM2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rp1l1Q8CGM2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rp1l1Q8CGM2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rp1l1Q8CGM2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Rp1l1Q8CGM2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Rp1l1Q8CGM2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rp1l1Q8CGM2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rp1l1Q8CGM2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rp1l1Q8CGM2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rp1l1Q8CGM2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms