Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDM4

Ccdc73, Coiled-coil domain-containing protein 73, mousemouse

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc73Q8CDM4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc73Q8CDM4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc73Q8CDM4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc73Q8CDM4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc73Q8CDM4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc73Q8CDM4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc73Q8CDM4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc73Q8CDM4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc73Q8CDM4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc73Q8CDM4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc73Q8CDM4 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ccdc73Q8CDM4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc73Q8CDM4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc73Q8CDM4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc73Q8CDM4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc73Q8CDM4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc73Q8CDM4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc73Q8CDM4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc73Q8CDM4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc73Q8CDM4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc73Q8CDM4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc73Q8CDM4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc73Q8CDM4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc73Q8CDM4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc73Q8CDM4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc73Q8CDM4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc73Q8CDM4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc73Q8CDM4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc73Q8CDM4 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc73Q8CDM4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc73Q8CDM4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc73Q8CDM4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc73Q8CDM4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc73Q8CDM4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc73Q8CDM4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc73Q8CDM4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc73Q8CDM4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc73Q8CDM4 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc73Q8CDM4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc73Q8CDM4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc73Q8CDM4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc73Q8CDM4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc73Q8CDM4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc73Q8CDM4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc73Q8CDM4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc73Q8CDM4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc73Q8CDM4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc73Q8CDM4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc73Q8CDM4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc73Q8CDM4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc73Q8CDM4 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc73Q8CDM4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc73Q8CDM4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc73Q8CDM4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc73Q8CDM4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc73Q8CDM4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc73Q8CDM4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc73Q8CDM4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc73Q8CDM4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc73Q8CDM4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc73Q8CDM4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc73Q8CDM4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc73Q8CDM4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc73Q8CDM4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc73Q8CDM4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc73Q8CDM4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc73Q8CDM4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc73Q8CDM4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc73Q8CDM4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc73Q8CDM4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc73Q8CDM4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc73Q8CDM4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc73Q8CDM4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc73Q8CDM4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc73Q8CDM4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc73Q8CDM4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc73Q8CDM4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccdc73Q8CDM4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccdc73Q8CDM4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc73Q8CDM4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc73Q8CDM4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc73Q8CDM4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc73Q8CDM4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc73Q8CDM4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc73Q8CDM4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc73Q8CDM4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc73Q8CDM4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc73Q8CDM4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc73Q8CDM4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc73Q8CDM4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc73Q8CDM4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc73Q8CDM4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc73Q8CDM4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc73Q8CDM4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc73Q8CDM4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc73Q8CDM4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc73Q8CDM4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc73Q8CDM4 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc73Q8CDM4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc73Q8CDM4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms