Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCX5

Krt222, Keratin-like protein KRT222, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt222Q8CCX5 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt222Q8CCX5 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt222Q8CCX5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt222Q8CCX5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt222Q8CCX5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt222Q8CCX5 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt222Q8CCX5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt222Q8CCX5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt222Q8CCX5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt222Q8CCX5 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt222Q8CCX5 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt222Q8CCX5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt222Q8CCX5 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt222Q8CCX5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt222Q8CCX5 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt222Q8CCX5 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt222Q8CCX5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt222Q8CCX5 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt222Q8CCX5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt222Q8CCX5 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt222Q8CCX5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt222Q8CCX5 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt222Q8CCX5 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt222Q8CCX5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt222Q8CCX5 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Krt222Q8CCX5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Krt222Q8CCX5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Krt222Q8CCX5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Krt222Q8CCX5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Krt222Q8CCX5 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Krt222Q8CCX5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Krt222Q8CCX5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Krt222Q8CCX5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Krt222Q8CCX5 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Krt222Q8CCX5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Krt222Q8CCX5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Krt222Q8CCX5 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Krt222Q8CCX5 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Krt222Q8CCX5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Krt222Q8CCX5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Krt222Q8CCX5 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Krt222Q8CCX5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Krt222Q8CCX5 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Krt222Q8CCX5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Krt222Q8CCX5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Krt222Q8CCX5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Krt222Q8CCX5 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Krt222Q8CCX5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Krt222Q8CCX5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Krt222Q8CCX5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Krt222Q8CCX5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Krt222Q8CCX5 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Krt222Q8CCX5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Krt222Q8CCX5 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Krt222Q8CCX5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Krt222Q8CCX5 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Krt222Q8CCX5 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Krt222Q8CCX5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Krt222Q8CCX5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Krt222Q8CCX5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Krt222Q8CCX5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Krt222Q8CCX5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Krt222Q8CCX5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Krt222Q8CCX5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Krt222Q8CCX5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Krt222Q8CCX5 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt222Q8CCX5 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt222Q8CCX5 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt222Q8CCX5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt222Q8CCX5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt222Q8CCX5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt222Q8CCX5 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt222Q8CCX5 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt222Q8CCX5 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt222Q8CCX5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt222Q8CCX5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt222Q8CCX5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt222Q8CCX5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt222Q8CCX5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt222Q8CCX5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt222Q8CCX5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt222Q8CCX5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt222Q8CCX5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt222Q8CCX5 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt222Q8CCX5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt222Q8CCX5 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt222Q8CCX5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt222Q8CCX5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt222Q8CCX5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt222Q8CCX5 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt222Q8CCX5 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt222Q8CCX5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt222Q8CCX5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt222Q8CCX5 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt222Q8CCX5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt222Q8CCX5 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt222Q8CCX5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt222Q8CCX5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt222Q8CCX5 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt222Q8CCX5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms