Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXJ2

Trerf1, Transcriptional-regulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trerf1Q8BXJ2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trerf1Q8BXJ2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trerf1Q8BXJ2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trerf1Q8BXJ2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trerf1Q8BXJ2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trerf1Q8BXJ2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trerf1Q8BXJ2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trerf1Q8BXJ2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trerf1Q8BXJ2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trerf1Q8BXJ2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trerf1Q8BXJ2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trerf1Q8BXJ2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trerf1Q8BXJ2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trerf1Q8BXJ2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trerf1Q8BXJ2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trerf1Q8BXJ2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trerf1Q8BXJ2 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Trerf1Q8BXJ2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Trerf1Q8BXJ2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trerf1Q8BXJ2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trerf1Q8BXJ2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trerf1Q8BXJ2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trerf1Q8BXJ2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trerf1Q8BXJ2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trerf1Q8BXJ2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trerf1Q8BXJ2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trerf1Q8BXJ2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trerf1Q8BXJ2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trerf1Q8BXJ2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trerf1Q8BXJ2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trerf1Q8BXJ2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trerf1Q8BXJ2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trerf1Q8BXJ2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trerf1Q8BXJ2 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trerf1Q8BXJ2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trerf1Q8BXJ2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Trerf1Q8BXJ2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trerf1Q8BXJ2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trerf1Q8BXJ2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Trerf1Q8BXJ2 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trerf1Q8BXJ2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trerf1Q8BXJ2 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trerf1Q8BXJ2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trerf1Q8BXJ2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trerf1Q8BXJ2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trerf1Q8BXJ2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trerf1Q8BXJ2 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trerf1Q8BXJ2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trerf1Q8BXJ2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trerf1Q8BXJ2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trerf1Q8BXJ2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trerf1Q8BXJ2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trerf1Q8BXJ2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trerf1Q8BXJ2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Trerf1Q8BXJ2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trerf1Q8BXJ2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Trerf1Q8BXJ2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Trerf1Q8BXJ2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trerf1Q8BXJ2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trerf1Q8BXJ2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trerf1Q8BXJ2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trerf1Q8BXJ2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trerf1Q8BXJ2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trerf1Q8BXJ2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trerf1Q8BXJ2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trerf1Q8BXJ2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trerf1Q8BXJ2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trerf1Q8BXJ2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trerf1Q8BXJ2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trerf1Q8BXJ2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trerf1Q8BXJ2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trerf1Q8BXJ2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trerf1Q8BXJ2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trerf1Q8BXJ2 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trerf1Q8BXJ2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trerf1Q8BXJ2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trerf1Q8BXJ2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Trerf1Q8BXJ2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trerf1Q8BXJ2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trerf1Q8BXJ2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trerf1Q8BXJ2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trerf1Q8BXJ2 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trerf1Q8BXJ2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trerf1Q8BXJ2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trerf1Q8BXJ2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trerf1Q8BXJ2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trerf1Q8BXJ2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Trerf1Q8BXJ2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trerf1Q8BXJ2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trerf1Q8BXJ2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trerf1Q8BXJ2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trerf1Q8BXJ2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trerf1Q8BXJ2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trerf1Q8BXJ2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trerf1Q8BXJ2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trerf1Q8BXJ2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Trerf1Q8BXJ2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trerf1Q8BXJ2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trerf1Q8BXJ2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trerf1Q8BXJ2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
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