Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKW4

Zcchc4, Zinc finger CCHC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc4Q8BKW4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Zcchc4Q8BKW4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Zcchc4Q8BKW4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Zcchc4Q8BKW4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Zcchc4Q8BKW4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Zcchc4Q8BKW4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Zcchc4Q8BKW4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Zcchc4Q8BKW4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Zcchc4Q8BKW4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Zcchc4Q8BKW4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Zcchc4Q8BKW4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Zcchc4Q8BKW4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Zcchc4Q8BKW4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Zcchc4Q8BKW4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Zcchc4Q8BKW4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Zcchc4Q8BKW4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Zcchc4Q8BKW4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Zcchc4Q8BKW4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Zcchc4Q8BKW4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Zcchc4Q8BKW4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Zcchc4Q8BKW4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Zcchc4Q8BKW4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Zcchc4Q8BKW4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Zcchc4Q8BKW4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Zcchc4Q8BKW4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Zcchc4Q8BKW4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Zcchc4Q8BKW4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Zcchc4Q8BKW4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Zcchc4Q8BKW4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Zcchc4Q8BKW4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Zcchc4Q8BKW4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Zcchc4Q8BKW4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Zcchc4Q8BKW4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Zcchc4Q8BKW4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Zcchc4Q8BKW4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Zcchc4Q8BKW4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Zcchc4Q8BKW4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Zcchc4Q8BKW4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Zcchc4Q8BKW4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Zcchc4Q8BKW4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Zcchc4Q8BKW4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Zcchc4Q8BKW4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Zcchc4Q8BKW4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Zcchc4Q8BKW4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Zcchc4Q8BKW4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Zcchc4Q8BKW4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Zcchc4Q8BKW4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Zcchc4Q8BKW4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Zcchc4Q8BKW4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Zcchc4Q8BKW4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Zcchc4Q8BKW4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Zcchc4Q8BKW4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Zcchc4Q8BKW4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Zcchc4Q8BKW4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Zcchc4Q8BKW4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Zcchc4Q8BKW4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Zcchc4Q8BKW4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Zcchc4Q8BKW4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Zcchc4Q8BKW4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Zcchc4Q8BKW4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Zcchc4Q8BKW4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Zcchc4Q8BKW4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Zcchc4Q8BKW4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Zcchc4Q8BKW4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Zcchc4Q8BKW4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Zcchc4Q8BKW4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Zcchc4Q8BKW4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Zcchc4Q8BKW4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Zcchc4Q8BKW4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Zcchc4Q8BKW4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Zcchc4Q8BKW4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Zcchc4Q8BKW4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Zcchc4Q8BKW4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Zcchc4Q8BKW4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Zcchc4Q8BKW4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Zcchc4Q8BKW4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Zcchc4Q8BKW4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Zcchc4Q8BKW4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Zcchc4Q8BKW4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Zcchc4Q8BKW4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Zcchc4Q8BKW4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Zcchc4Q8BKW4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Zcchc4Q8BKW4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Zcchc4Q8BKW4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Zcchc4Q8BKW4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Zcchc4Q8BKW4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Zcchc4Q8BKW4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Zcchc4Q8BKW4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Zcchc4Q8BKW4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Zcchc4Q8BKW4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Zcchc4Q8BKW4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Zcchc4Q8BKW4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Zcchc4Q8BKW4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Zcchc4Q8BKW4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Zcchc4Q8BKW4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Zcchc4Q8BKW4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Zcchc4Q8BKW4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Zcchc4Q8BKW4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Zcchc4Q8BKW4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Zcchc4Q8BKW4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms