Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKT3

Gcfc2, GC-rich sequence DNA-binding factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcfc2Q8BKT3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Gcfc2Q8BKT3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gcfc2Q8BKT3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gcfc2Q8BKT3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gcfc2Q8BKT3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gcfc2Q8BKT3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gcfc2Q8BKT3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gcfc2Q8BKT3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gcfc2Q8BKT3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gcfc2Q8BKT3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gcfc2Q8BKT3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Gcfc2Q8BKT3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gcfc2Q8BKT3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gcfc2Q8BKT3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gcfc2Q8BKT3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gcfc2Q8BKT3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gcfc2Q8BKT3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gcfc2Q8BKT3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gcfc2Q8BKT3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gcfc2Q8BKT3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gcfc2Q8BKT3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gcfc2Q8BKT3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gcfc2Q8BKT3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gcfc2Q8BKT3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gcfc2Q8BKT3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gcfc2Q8BKT3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gcfc2Q8BKT3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gcfc2Q8BKT3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gcfc2Q8BKT3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gcfc2Q8BKT3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gcfc2Q8BKT3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gcfc2Q8BKT3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gcfc2Q8BKT3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gcfc2Q8BKT3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gcfc2Q8BKT3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gcfc2Q8BKT3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gcfc2Q8BKT3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gcfc2Q8BKT3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gcfc2Q8BKT3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gcfc2Q8BKT3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gcfc2Q8BKT3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gcfc2Q8BKT3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gcfc2Q8BKT3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Gcfc2Q8BKT3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gcfc2Q8BKT3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gcfc2Q8BKT3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gcfc2Q8BKT3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gcfc2Q8BKT3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gcfc2Q8BKT3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gcfc2Q8BKT3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gcfc2Q8BKT3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gcfc2Q8BKT3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gcfc2Q8BKT3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gcfc2Q8BKT3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gcfc2Q8BKT3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gcfc2Q8BKT3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gcfc2Q8BKT3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gcfc2Q8BKT3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gcfc2Q8BKT3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gcfc2Q8BKT3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gcfc2Q8BKT3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gcfc2Q8BKT3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gcfc2Q8BKT3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gcfc2Q8BKT3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gcfc2Q8BKT3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gcfc2Q8BKT3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gcfc2Q8BKT3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gcfc2Q8BKT3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gcfc2Q8BKT3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gcfc2Q8BKT3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Gcfc2Q8BKT3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gcfc2Q8BKT3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gcfc2Q8BKT3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gcfc2Q8BKT3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gcfc2Q8BKT3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gcfc2Q8BKT3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gcfc2Q8BKT3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gcfc2Q8BKT3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gcfc2Q8BKT3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gcfc2Q8BKT3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Gcfc2Q8BKT3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gcfc2Q8BKT3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gcfc2Q8BKT3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gcfc2Q8BKT3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gcfc2Q8BKT3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gcfc2Q8BKT3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gcfc2Q8BKT3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gcfc2Q8BKT3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gcfc2Q8BKT3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gcfc2Q8BKT3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Gcfc2Q8BKT3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gcfc2Q8BKT3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gcfc2Q8BKT3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gcfc2Q8BKT3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gcfc2Q8BKT3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gcfc2Q8BKT3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gcfc2Q8BKT3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gcfc2Q8BKT3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gcfc2Q8BKT3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Gcfc2Q8BKT3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms