Protein–RNA interactions for Protein: Q80XD1

Chn2, Beta-chimaerin, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chn2Q80XD1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chn2Q80XD1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chn2Q80XD1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chn2Q80XD1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chn2Q80XD1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chn2Q80XD1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chn2Q80XD1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chn2Q80XD1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chn2Q80XD1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chn2Q80XD1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chn2Q80XD1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chn2Q80XD1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chn2Q80XD1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chn2Q80XD1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chn2Q80XD1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chn2Q80XD1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chn2Q80XD1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chn2Q80XD1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chn2Q80XD1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chn2Q80XD1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chn2Q80XD1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chn2Q80XD1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chn2Q80XD1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chn2Q80XD1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chn2Q80XD1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chn2Q80XD1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Chn2Q80XD1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chn2Q80XD1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chn2Q80XD1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chn2Q80XD1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chn2Q80XD1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chn2Q80XD1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chn2Q80XD1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chn2Q80XD1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chn2Q80XD1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chn2Q80XD1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chn2Q80XD1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chn2Q80XD1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chn2Q80XD1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chn2Q80XD1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chn2Q80XD1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chn2Q80XD1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chn2Q80XD1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chn2Q80XD1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chn2Q80XD1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chn2Q80XD1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chn2Q80XD1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chn2Q80XD1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chn2Q80XD1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chn2Q80XD1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chn2Q80XD1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chn2Q80XD1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chn2Q80XD1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chn2Q80XD1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chn2Q80XD1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chn2Q80XD1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chn2Q80XD1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chn2Q80XD1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Chn2Q80XD1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chn2Q80XD1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Chn2Q80XD1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chn2Q80XD1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chn2Q80XD1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Chn2Q80XD1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chn2Q80XD1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chn2Q80XD1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chn2Q80XD1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chn2Q80XD1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chn2Q80XD1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chn2Q80XD1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chn2Q80XD1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chn2Q80XD1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Chn2Q80XD1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chn2Q80XD1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Chn2Q80XD1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chn2Q80XD1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chn2Q80XD1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chn2Q80XD1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chn2Q80XD1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chn2Q80XD1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chn2Q80XD1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chn2Q80XD1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chn2Q80XD1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Chn2Q80XD1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chn2Q80XD1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chn2Q80XD1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chn2Q80XD1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chn2Q80XD1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chn2Q80XD1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chn2Q80XD1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chn2Q80XD1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chn2Q80XD1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chn2Q80XD1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chn2Q80XD1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Chn2Q80XD1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Chn2Q80XD1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Chn2Q80XD1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Chn2Q80XD1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Chn2Q80XD1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Chn2Q80XD1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms