Protein–RNA interactions for Protein: Q80VW5

Whrn, Whirlin, mousemouse

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WhrnQ80VW5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
WhrnQ80VW5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
WhrnQ80VW5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
WhrnQ80VW5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
WhrnQ80VW5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
WhrnQ80VW5 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
WhrnQ80VW5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
WhrnQ80VW5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
WhrnQ80VW5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
WhrnQ80VW5 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
WhrnQ80VW5 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
WhrnQ80VW5 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
WhrnQ80VW5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
WhrnQ80VW5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
WhrnQ80VW5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
WhrnQ80VW5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
WhrnQ80VW5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
WhrnQ80VW5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
WhrnQ80VW5 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
WhrnQ80VW5 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
WhrnQ80VW5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
WhrnQ80VW5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
WhrnQ80VW5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
WhrnQ80VW5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
WhrnQ80VW5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
WhrnQ80VW5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
WhrnQ80VW5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
WhrnQ80VW5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
WhrnQ80VW5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
WhrnQ80VW5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
WhrnQ80VW5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
WhrnQ80VW5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
WhrnQ80VW5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
WhrnQ80VW5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
WhrnQ80VW5 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
WhrnQ80VW5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
WhrnQ80VW5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
WhrnQ80VW5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
WhrnQ80VW5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
WhrnQ80VW5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
WhrnQ80VW5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
WhrnQ80VW5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
WhrnQ80VW5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
WhrnQ80VW5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
WhrnQ80VW5 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
WhrnQ80VW5 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
WhrnQ80VW5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
WhrnQ80VW5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
WhrnQ80VW5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
WhrnQ80VW5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
WhrnQ80VW5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
WhrnQ80VW5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
WhrnQ80VW5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
WhrnQ80VW5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
WhrnQ80VW5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
WhrnQ80VW5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
WhrnQ80VW5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
WhrnQ80VW5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
WhrnQ80VW5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
WhrnQ80VW5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
WhrnQ80VW5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
WhrnQ80VW5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
WhrnQ80VW5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
WhrnQ80VW5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
WhrnQ80VW5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
WhrnQ80VW5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
WhrnQ80VW5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
WhrnQ80VW5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
WhrnQ80VW5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
WhrnQ80VW5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
WhrnQ80VW5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
WhrnQ80VW5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
WhrnQ80VW5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
WhrnQ80VW5 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
WhrnQ80VW5 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
WhrnQ80VW5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
WhrnQ80VW5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
WhrnQ80VW5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
WhrnQ80VW5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
WhrnQ80VW5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
WhrnQ80VW5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
WhrnQ80VW5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
WhrnQ80VW5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
WhrnQ80VW5 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
WhrnQ80VW5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
WhrnQ80VW5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
WhrnQ80VW5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
WhrnQ80VW5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
WhrnQ80VW5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
WhrnQ80VW5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
WhrnQ80VW5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
WhrnQ80VW5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
WhrnQ80VW5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
WhrnQ80VW5 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
WhrnQ80VW5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
WhrnQ80VW5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
WhrnQ80VW5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
WhrnQ80VW5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
WhrnQ80VW5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
WhrnQ80VW5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms