Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Avl9Q80U56 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Avl9Q80U56 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Avl9Q80U56 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Avl9Q80U56 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Avl9Q80U56 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Avl9Q80U56 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Avl9Q80U56 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Avl9Q80U56 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Avl9Q80U56 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Avl9Q80U56 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Avl9Q80U56 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Avl9Q80U56 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Avl9Q80U56 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Avl9Q80U56 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Avl9Q80U56 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Avl9Q80U56 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Avl9Q80U56 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Avl9Q80U56 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Avl9Q80U56 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Avl9Q80U56 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Avl9Q80U56 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Avl9Q80U56 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Avl9Q80U56 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Avl9Q80U56 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Avl9Q80U56 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Avl9Q80U56 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Avl9Q80U56 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Avl9Q80U56 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Avl9Q80U56 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Avl9Q80U56 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Avl9Q80U56 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Avl9Q80U56 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Avl9Q80U56 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Avl9Q80U56 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Avl9Q80U56 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Avl9Q80U56 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Avl9Q80U56 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Avl9Q80U56 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Avl9Q80U56 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Avl9Q80U56 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Avl9Q80U56 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Avl9Q80U56 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Avl9Q80U56 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Avl9Q80U56 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Avl9Q80U56 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Avl9Q80U56 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Avl9Q80U56 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Avl9Q80U56 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Avl9Q80U56 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Avl9Q80U56 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Avl9Q80U56 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Avl9Q80U56 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Avl9Q80U56 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Avl9Q80U56 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Avl9Q80U56 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Avl9Q80U56 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Avl9Q80U56 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Avl9Q80U56 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Avl9Q80U56 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Avl9Q80U56 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Avl9Q80U56 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Avl9Q80U56 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Avl9Q80U56 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Avl9Q80U56 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Avl9Q80U56 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Avl9Q80U56 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Avl9Q80U56 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Avl9Q80U56 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Avl9Q80U56 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Avl9Q80U56 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Avl9Q80U56 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Avl9Q80U56 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Avl9Q80U56 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Avl9Q80U56 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Avl9Q80U56 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Avl9Q80U56 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Avl9Q80U56 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Avl9Q80U56 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Avl9Q80U56 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Avl9Q80U56 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Avl9Q80U56 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Avl9Q80U56 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Avl9Q80U56 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Avl9Q80U56 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Avl9Q80U56 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Avl9Q80U56 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Avl9Q80U56 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Avl9Q80U56 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Avl9Q80U56 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Avl9Q80U56 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Avl9Q80U56 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Avl9Q80U56 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Avl9Q80U56 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Avl9Q80U56 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Avl9Q80U56 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Avl9Q80U56 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Avl9Q80U56 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Avl9Q80U56 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Avl9Q80U56 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms