Protein–RNA interactions for Protein: Q80U04

Pja2, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja2Q80U04 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pja2Q80U04 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pja2Q80U04 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pja2Q80U04 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pja2Q80U04 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pja2Q80U04 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pja2Q80U04 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pja2Q80U04 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pja2Q80U04 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pja2Q80U04 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pja2Q80U04 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pja2Q80U04 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pja2Q80U04 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pja2Q80U04 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pja2Q80U04 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pja2Q80U04 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pja2Q80U04 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pja2Q80U04 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pja2Q80U04 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pja2Q80U04 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pja2Q80U04 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pja2Q80U04 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pja2Q80U04 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pja2Q80U04 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pja2Q80U04 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pja2Q80U04 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Pja2Q80U04 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pja2Q80U04 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pja2Q80U04 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pja2Q80U04 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pja2Q80U04 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pja2Q80U04 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pja2Q80U04 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pja2Q80U04 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pja2Q80U04 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pja2Q80U04 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Pja2Q80U04 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pja2Q80U04 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pja2Q80U04 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pja2Q80U04 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pja2Q80U04 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Pja2Q80U04 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pja2Q80U04 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pja2Q80U04 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pja2Q80U04 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pja2Q80U04 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pja2Q80U04 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pja2Q80U04 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pja2Q80U04 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pja2Q80U04 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pja2Q80U04 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pja2Q80U04 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pja2Q80U04 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Pja2Q80U04 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pja2Q80U04 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pja2Q80U04 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pja2Q80U04 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pja2Q80U04 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pja2Q80U04 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pja2Q80U04 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pja2Q80U04 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Pja2Q80U04 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pja2Q80U04 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pja2Q80U04 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pja2Q80U04 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pja2Q80U04 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Pja2Q80U04 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pja2Q80U04 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pja2Q80U04 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pja2Q80U04 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pja2Q80U04 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Pja2Q80U04 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pja2Q80U04 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pja2Q80U04 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pja2Q80U04 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pja2Q80U04 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pja2Q80U04 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pja2Q80U04 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pja2Q80U04 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pja2Q80U04 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pja2Q80U04 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pja2Q80U04 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pja2Q80U04 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pja2Q80U04 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pja2Q80U04 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pja2Q80U04 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pja2Q80U04 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pja2Q80U04 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Pja2Q80U04 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pja2Q80U04 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pja2Q80U04 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pja2Q80U04 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Pja2Q80U04 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pja2Q80U04 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pja2Q80U04 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pja2Q80U04 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pja2Q80U04 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Pja2Q80U04 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pja2Q80U04 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pja2Q80U04 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms