Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dsg1bQ7TSF1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dsg1bQ7TSF1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Dsg1bQ7TSF1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Dsg1bQ7TSF1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dsg1bQ7TSF1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dsg1bQ7TSF1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Dsg1bQ7TSF1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dsg1bQ7TSF1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dsg1bQ7TSF1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dsg1bQ7TSF1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dsg1bQ7TSF1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dsg1bQ7TSF1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dsg1bQ7TSF1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dsg1bQ7TSF1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dsg1bQ7TSF1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dsg1bQ7TSF1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dsg1bQ7TSF1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dsg1bQ7TSF1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dsg1bQ7TSF1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dsg1bQ7TSF1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dsg1bQ7TSF1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dsg1bQ7TSF1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dsg1bQ7TSF1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dsg1bQ7TSF1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dsg1bQ7TSF1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dsg1bQ7TSF1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dsg1bQ7TSF1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dsg1bQ7TSF1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dsg1bQ7TSF1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dsg1bQ7TSF1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dsg1bQ7TSF1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dsg1bQ7TSF1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dsg1bQ7TSF1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dsg1bQ7TSF1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dsg1bQ7TSF1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dsg1bQ7TSF1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dsg1bQ7TSF1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dsg1bQ7TSF1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dsg1bQ7TSF1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dsg1bQ7TSF1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dsg1bQ7TSF1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dsg1bQ7TSF1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dsg1bQ7TSF1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dsg1bQ7TSF1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dsg1bQ7TSF1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dsg1bQ7TSF1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Dsg1bQ7TSF1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Dsg1bQ7TSF1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Dsg1bQ7TSF1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Dsg1bQ7TSF1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Dsg1bQ7TSF1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Dsg1bQ7TSF1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dsg1bQ7TSF1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dsg1bQ7TSF1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dsg1bQ7TSF1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dsg1bQ7TSF1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dsg1bQ7TSF1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dsg1bQ7TSF1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dsg1bQ7TSF1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dsg1bQ7TSF1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dsg1bQ7TSF1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dsg1bQ7TSF1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dsg1bQ7TSF1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dsg1bQ7TSF1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dsg1bQ7TSF1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Dsg1bQ7TSF1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dsg1bQ7TSF1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dsg1bQ7TSF1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dsg1bQ7TSF1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dsg1bQ7TSF1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dsg1bQ7TSF1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dsg1bQ7TSF1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dsg1bQ7TSF1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Dsg1bQ7TSF1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dsg1bQ7TSF1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dsg1bQ7TSF1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dsg1bQ7TSF1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dsg1bQ7TSF1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dsg1bQ7TSF1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dsg1bQ7TSF1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dsg1bQ7TSF1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dsg1bQ7TSF1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dsg1bQ7TSF1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dsg1bQ7TSF1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Dsg1bQ7TSF1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Dsg1bQ7TSF1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Dsg1bQ7TSF1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dsg1bQ7TSF1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dsg1bQ7TSF1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dsg1bQ7TSF1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dsg1bQ7TSF1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dsg1bQ7TSF1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dsg1bQ7TSF1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dsg1bQ7TSF1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dsg1bQ7TSF1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Dsg1bQ7TSF1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dsg1bQ7TSF1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Dsg1bQ7TSF1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
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