Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfsf18Q7TS55 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfsf18Q7TS55 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfsf18Q7TS55 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfsf18Q7TS55 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfsf18Q7TS55 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfsf18Q7TS55 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfsf18Q7TS55 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfsf18Q7TS55 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfsf18Q7TS55 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfsf18Q7TS55 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfsf18Q7TS55 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfsf18Q7TS55 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfsf18Q7TS55 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfsf18Q7TS55 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfsf18Q7TS55 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfsf18Q7TS55 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfsf18Q7TS55 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfsf18Q7TS55 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfsf18Q7TS55 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfsf18Q7TS55 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfsf18Q7TS55 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfsf18Q7TS55 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfsf18Q7TS55 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfsf18Q7TS55 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfsf18Q7TS55 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfsf18Q7TS55 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfsf18Q7TS55 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfsf18Q7TS55 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfsf18Q7TS55 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfsf18Q7TS55 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfsf18Q7TS55 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf18Q7TS55 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf18Q7TS55 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf18Q7TS55 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf18Q7TS55 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf18Q7TS55 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf18Q7TS55 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf18Q7TS55 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf18Q7TS55 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf18Q7TS55 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf18Q7TS55 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf18Q7TS55 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf18Q7TS55 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf18Q7TS55 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf18Q7TS55 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf18Q7TS55 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf18Q7TS55 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf18Q7TS55 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf18Q7TS55 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf18Q7TS55 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf18Q7TS55 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf18Q7TS55 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf18Q7TS55 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf18Q7TS55 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf18Q7TS55 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf18Q7TS55 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf18Q7TS55 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf18Q7TS55 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf18Q7TS55 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf18Q7TS55 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf18Q7TS55 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf18Q7TS55 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf18Q7TS55 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf18Q7TS55 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf18Q7TS55 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf18Q7TS55 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf18Q7TS55 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsf18Q7TS55 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsf18Q7TS55 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsf18Q7TS55 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsf18Q7TS55 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsf18Q7TS55 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsf18Q7TS55 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsf18Q7TS55 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsf18Q7TS55 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf18Q7TS55 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf18Q7TS55 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf18Q7TS55 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf18Q7TS55 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf18Q7TS55 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf18Q7TS55 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf18Q7TS55 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf18Q7TS55 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf18Q7TS55 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf18Q7TS55 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf18Q7TS55 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tnfsf18Q7TS55 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tnfsf18Q7TS55 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tnfsf18Q7TS55 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfsf18Q7TS55 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfsf18Q7TS55 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfsf18Q7TS55 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfsf18Q7TS55 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfsf18Q7TS55 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfsf18Q7TS55 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfsf18Q7TS55 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfsf18Q7TS55 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfsf18Q7TS55 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfsf18Q7TS55 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94 ms