Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Actn1Q7TPR4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Actn1Q7TPR4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Actn1Q7TPR4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Actn1Q7TPR4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Actn1Q7TPR4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Actn1Q7TPR4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Actn1Q7TPR4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Actn1Q7TPR4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Actn1Q7TPR4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Actn1Q7TPR4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Actn1Q7TPR4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Actn1Q7TPR4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Actn1Q7TPR4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Actn1Q7TPR4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Actn1Q7TPR4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Actn1Q7TPR4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Actn1Q7TPR4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Actn1Q7TPR4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Actn1Q7TPR4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Actn1Q7TPR4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Actn1Q7TPR4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Actn1Q7TPR4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Actn1Q7TPR4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Actn1Q7TPR4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Actn1Q7TPR4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Actn1Q7TPR4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Actn1Q7TPR4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Actn1Q7TPR4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Actn1Q7TPR4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Actn1Q7TPR4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Actn1Q7TPR4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Actn1Q7TPR4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Actn1Q7TPR4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Actn1Q7TPR4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Actn1Q7TPR4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Actn1Q7TPR4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Actn1Q7TPR4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Actn1Q7TPR4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Actn1Q7TPR4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Actn1Q7TPR4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Actn1Q7TPR4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Actn1Q7TPR4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Actn1Q7TPR4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Actn1Q7TPR4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Actn1Q7TPR4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Actn1Q7TPR4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Actn1Q7TPR4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Actn1Q7TPR4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Actn1Q7TPR4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Actn1Q7TPR4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Actn1Q7TPR4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Actn1Q7TPR4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Actn1Q7TPR4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Actn1Q7TPR4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Actn1Q7TPR4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Actn1Q7TPR4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Actn1Q7TPR4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Actn1Q7TPR4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Actn1Q7TPR4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Actn1Q7TPR4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Actn1Q7TPR4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Actn1Q7TPR4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Actn1Q7TPR4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Actn1Q7TPR4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Actn1Q7TPR4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Actn1Q7TPR4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Actn1Q7TPR4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Actn1Q7TPR4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Actn1Q7TPR4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Actn1Q7TPR4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Actn1Q7TPR4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Actn1Q7TPR4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Actn1Q7TPR4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Actn1Q7TPR4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Actn1Q7TPR4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Actn1Q7TPR4 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Actn1Q7TPR4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Actn1Q7TPR4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Actn1Q7TPR4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Actn1Q7TPR4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Actn1Q7TPR4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Actn1Q7TPR4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Actn1Q7TPR4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Actn1Q7TPR4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Actn1Q7TPR4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Actn1Q7TPR4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Actn1Q7TPR4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Actn1Q7TPR4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Actn1Q7TPR4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Actn1Q7TPR4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Actn1Q7TPR4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Actn1Q7TPR4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Actn1Q7TPR4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Actn1Q7TPR4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Actn1Q7TPR4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Actn1Q7TPR4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Actn1Q7TPR4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Actn1Q7TPR4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Actn1Q7TPR4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms