Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMM9

Tubb2a, Tubulin beta-2A chain, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb2aQ7TMM9 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tubb2aQ7TMM9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tubb2aQ7TMM9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tubb2aQ7TMM9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tubb2aQ7TMM9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tubb2aQ7TMM9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tubb2aQ7TMM9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tubb2aQ7TMM9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tubb2aQ7TMM9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tubb2aQ7TMM9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tubb2aQ7TMM9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tubb2aQ7TMM9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tubb2aQ7TMM9 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tubb2aQ7TMM9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tubb2aQ7TMM9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tubb2aQ7TMM9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tubb2aQ7TMM9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tubb2aQ7TMM9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tubb2aQ7TMM9 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tubb2aQ7TMM9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Tubb2aQ7TMM9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tubb2aQ7TMM9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tubb2aQ7TMM9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tubb2aQ7TMM9 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tubb2aQ7TMM9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tubb2aQ7TMM9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tubb2aQ7TMM9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tubb2aQ7TMM9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tubb2aQ7TMM9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tubb2aQ7TMM9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tubb2aQ7TMM9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tubb2aQ7TMM9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tubb2aQ7TMM9 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tubb2aQ7TMM9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tubb2aQ7TMM9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tubb2aQ7TMM9 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tubb2aQ7TMM9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tubb2aQ7TMM9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tubb2aQ7TMM9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tubb2aQ7TMM9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tubb2aQ7TMM9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tubb2aQ7TMM9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tubb2aQ7TMM9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tubb2aQ7TMM9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tubb2aQ7TMM9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tubb2aQ7TMM9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Tubb2aQ7TMM9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tubb2aQ7TMM9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tubb2aQ7TMM9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tubb2aQ7TMM9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tubb2aQ7TMM9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Tubb2aQ7TMM9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tubb2aQ7TMM9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tubb2aQ7TMM9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Tubb2aQ7TMM9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tubb2aQ7TMM9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Tubb2aQ7TMM9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tubb2aQ7TMM9 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tubb2aQ7TMM9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tubb2aQ7TMM9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Tubb2aQ7TMM9 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tubb2aQ7TMM9 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tubb2aQ7TMM9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tubb2aQ7TMM9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Tubb2aQ7TMM9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tubb2aQ7TMM9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tubb2aQ7TMM9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tubb2aQ7TMM9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tubb2aQ7TMM9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tubb2aQ7TMM9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tubb2aQ7TMM9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tubb2aQ7TMM9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tubb2aQ7TMM9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tubb2aQ7TMM9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tubb2aQ7TMM9 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tubb2aQ7TMM9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tubb2aQ7TMM9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tubb2aQ7TMM9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Tubb2aQ7TMM9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tubb2aQ7TMM9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tubb2aQ7TMM9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tubb2aQ7TMM9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tubb2aQ7TMM9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tubb2aQ7TMM9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tubb2aQ7TMM9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tubb2aQ7TMM9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tubb2aQ7TMM9 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tubb2aQ7TMM9 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tubb2aQ7TMM9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tubb2aQ7TMM9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tubb2aQ7TMM9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tubb2aQ7TMM9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tubb2aQ7TMM9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tubb2aQ7TMM9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tubb2aQ7TMM9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tubb2aQ7TMM9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tubb2aQ7TMM9 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tubb2aQ7TMM9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tubb2aQ7TMM9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tubb2aQ7TMM9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms