Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMB8

Cyfip1, Cytoplasmic FMR1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyfip1Q7TMB8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cyfip1Q7TMB8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cyfip1Q7TMB8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cyfip1Q7TMB8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cyfip1Q7TMB8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Cyfip1Q7TMB8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cyfip1Q7TMB8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cyfip1Q7TMB8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cyfip1Q7TMB8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cyfip1Q7TMB8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cyfip1Q7TMB8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cyfip1Q7TMB8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cyfip1Q7TMB8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cyfip1Q7TMB8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cyfip1Q7TMB8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cyfip1Q7TMB8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cyfip1Q7TMB8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cyfip1Q7TMB8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Cyfip1Q7TMB8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cyfip1Q7TMB8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cyfip1Q7TMB8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cyfip1Q7TMB8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cyfip1Q7TMB8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cyfip1Q7TMB8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cyfip1Q7TMB8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cyfip1Q7TMB8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cyfip1Q7TMB8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cyfip1Q7TMB8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cyfip1Q7TMB8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cyfip1Q7TMB8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cyfip1Q7TMB8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cyfip1Q7TMB8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cyfip1Q7TMB8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cyfip1Q7TMB8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cyfip1Q7TMB8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cyfip1Q7TMB8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cyfip1Q7TMB8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cyfip1Q7TMB8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cyfip1Q7TMB8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cyfip1Q7TMB8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cyfip1Q7TMB8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cyfip1Q7TMB8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cyfip1Q7TMB8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cyfip1Q7TMB8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cyfip1Q7TMB8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cyfip1Q7TMB8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cyfip1Q7TMB8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cyfip1Q7TMB8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cyfip1Q7TMB8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cyfip1Q7TMB8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cyfip1Q7TMB8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cyfip1Q7TMB8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cyfip1Q7TMB8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cyfip1Q7TMB8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cyfip1Q7TMB8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cyfip1Q7TMB8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Cyfip1Q7TMB8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Cyfip1Q7TMB8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cyfip1Q7TMB8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cyfip1Q7TMB8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cyfip1Q7TMB8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Cyfip1Q7TMB8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Cyfip1Q7TMB8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cyfip1Q7TMB8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cyfip1Q7TMB8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cyfip1Q7TMB8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cyfip1Q7TMB8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cyfip1Q7TMB8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Cyfip1Q7TMB8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cyfip1Q7TMB8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cyfip1Q7TMB8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cyfip1Q7TMB8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cyfip1Q7TMB8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cyfip1Q7TMB8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cyfip1Q7TMB8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cyfip1Q7TMB8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Cyfip1Q7TMB8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cyfip1Q7TMB8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cyfip1Q7TMB8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cyfip1Q7TMB8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cyfip1Q7TMB8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cyfip1Q7TMB8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cyfip1Q7TMB8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cyfip1Q7TMB8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cyfip1Q7TMB8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cyfip1Q7TMB8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cyfip1Q7TMB8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Cyfip1Q7TMB8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cyfip1Q7TMB8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cyfip1Q7TMB8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cyfip1Q7TMB8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cyfip1Q7TMB8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cyfip1Q7TMB8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cyfip1Q7TMB8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cyfip1Q7TMB8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cyfip1Q7TMB8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cyfip1Q7TMB8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Cyfip1Q7TMB8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cyfip1Q7TMB8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cyfip1Q7TMB8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76 ms